Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ88

Pnpla7, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla7A2AJ88 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pnpla7A2AJ88 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pnpla7A2AJ88 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pnpla7A2AJ88 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pnpla7A2AJ88 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pnpla7A2AJ88 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pnpla7A2AJ88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pnpla7A2AJ88 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Pnpla7A2AJ88 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pnpla7A2AJ88 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pnpla7A2AJ88 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Pnpla7A2AJ88 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms