Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm12A2AJ77 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm12A2AJ77 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm12A2AJ77 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm12A2AJ77 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm12A2AJ77 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms