RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591568.1

CCR10-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 10, humanhuman

TSL 3

Gene CCR10, Length 994 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR10-202ENST00000591568 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.25■■■■■ 6.6
CCR10-202ENST00000591568 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.21■■■■■ 5.63
CCR10-202ENST00000591568 ABCC9O60706 1549 aa49.54■■■■■ 5.52
CCR10-202ENST00000591568 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.46■■■■■ 5.19
CCR10-202ENST00000591568 NACADO15069 1562 aa47.31■■■■■ 5.16
CCR10-202ENST00000591568 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.17■■■■■ 5.14
CCR10-202ENST00000591568 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.89■■■■■ 5.1
CCR10-202ENST00000591568 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
CCR10-202ENST00000591568 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.52■■■■■ 5.04
CCR10-202ENST00000591568 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.37■■■■■ 5.01
CCR10-202ENST00000591568 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.22■■■■■ 4.99
CCR10-202ENST00000591568 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.05■■■■■ 4.96
CCR10-202ENST00000591568 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.85■■■■■ 4.93
CCR10-202ENST00000591568 SCRIBQ14160 1630 aa45.78■■■■■ 4.92
CCR10-202ENST00000591568 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.54■■■■■ 4.88
CCR10-202ENST00000591568 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
CCR10-202ENST00000591568 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.79■■■■■ 4.76
CCR10-202ENST00000591568 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.57■■■■■ 4.73
CCR10-202ENST00000591568 SMARCA4P51532 1647 aa43.74■■■■■ 4.59
CCR10-202ENST00000591568 NCAPD3P42695 1498 aa43.65■■■■■ 4.58
CCR10-202ENST00000591568 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.58
CCR10-202ENST00000591568 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.62■■■■■ 4.57
CCR10-202ENST00000591568 SMARCA2P51531 1590 aa43.55■■■■■ 4.56
CCR10-202ENST00000591568 HMGXB3Q12766 1538 aa43.41■■■■■ 4.54
CCR10-202ENST00000591568 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.35■■■■■ 4.53
CCR10-202ENST00000591568 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.33■■■■■ 4.53
CCR10-202ENST00000591568 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
CCR10-202ENST00000591568 WIZO95785 1651 aa42.86■■■■■ 4.45
CCR10-202ENST00000591568 NESP48681 1621 aa42.75■■■■■ 4.43
CCR10-202ENST00000591568 ERCC6Q03468 1493 aa42.74■■■■■ 4.43
CCR10-202ENST00000591568 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
CCR10-202ENST00000591568 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.58■■■■■ 4.41
CCR10-202ENST00000591568 CUX2O14529 1486 aa42.45■■■■■ 4.39
CCR10-202ENST00000591568 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
CCR10-202ENST00000591568 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.36■■■■■ 4.37
CCR10-202ENST00000591568 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.3■■■■■ 4.36
CCR10-202ENST00000591568 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.22■■■■■ 4.35
CCR10-202ENST00000591568 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
CCR10-202ENST00000591568 CFTRP13569 1480 aa42.03■■■■■ 4.32
CCR10-202ENST00000591568 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.91■■■■■ 4.3
CCR10-202ENST00000591568 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.88■■■■■ 4.29
CCR10-202ENST00000591568 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.88■■■■■ 4.29
CCR10-202ENST00000591568 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.88■■■■■ 4.29
CCR10-202ENST00000591568 WDR62O43379 1518 aa41.79■■■■■ 4.28
CCR10-202ENST00000591568 PRDM2Q13029 1718 aa41.66■■■■■ 4.26
CCR10-202ENST00000591568 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.64■■■■■ 4.26
CCR10-202ENST00000591568 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
CCR10-202ENST00000591568 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
CCR10-202ENST00000591568 TOPBP1Q92547 1522 aa41.16■■■■■ 4.18
CCR10-202ENST00000591568 ABCC8Q09428 1581 aa41.13■■■■■ 4.18
CCR10-202ENST00000591568 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.08■■■■■ 4.17
CCR10-202ENST00000591568 IFT140Q96RY7 1462 aa41.02■■■■■ 4.16
CCR10-202ENST00000591568 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CCR10-202ENST00000591568 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
CCR10-202ENST00000591568 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
CCR10-202ENST00000591568 CUX1P39880 1505 aa40.69■■■■■ 4.1
CCR10-202ENST00000591568 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
CCR10-202ENST00000591568 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.63■■■■■ 4.09
CCR10-202ENST00000591568 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.62■■■■■ 4.09
CCR10-202ENST00000591568 SOGA1O94964 1423 aa40.6■■■■■ 4.09
CCR10-202ENST00000591568 OSCARQ8IYS5 282 aa40.6■■■■■ 4.09
CCR10-202ENST00000591568 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.58■■■■■ 4.09
CCR10-202ENST00000591568 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
CCR10-202ENST00000591568 WDR97A6NE52 1622 aa40.41■■■■■ 4.06
CCR10-202ENST00000591568 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
CCR10-202ENST00000591568 CHD1O14646 1710 aa40.25■■■■■ 4.03
CCR10-202ENST00000591568 TOP2BQ02880 1626 aa40.23■■■■■ 4.03
CCR10-202ENST00000591568 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.23■■■■■ 4.03
CCR10-202ENST00000591568 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.21■■■■■ 4.03
CCR10-202ENST00000591568 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.2■■■■■ 4.03
CCR10-202ENST00000591568 GRIN2BQ13224 1484 aa40.19■■■■■ 4.03
CCR10-202ENST00000591568 SYNJ1O43426 1573 aa40.19■■■■■ 4.02
CCR10-202ENST00000591568 FBLN2P98095 1184 aa40.18■■■■■ 4.02
CCR10-202ENST00000591568 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.13■■■■■ 4.02
CCR10-202ENST00000591568 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
CCR10-202ENST00000591568 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.09■■■■■ 4.01
CCR10-202ENST00000591568 TRIM41Q8WV44 630 aa40.09■■■■■ 4.01
CCR10-202ENST00000591568 PBRM1Q86U86 1689 aa40.08■■■■■ 4.01
CCR10-202ENST00000591568 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.01■■■■■ 4
CCR10-202ENST00000591568 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.01■■■■■ 4
CCR10-202ENST00000591568 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.01■■■■■ 4
CCR10-202ENST00000591568 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
CCR10-202ENST00000591568 SYNJ2O15056 1496 aa39.99■■■■□ 3.99
CCR10-202ENST00000591568 ARHGEF11O15085 1522 aa39.96■■■■□ 3.99
CCR10-202ENST00000591568 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.81■■■■□ 3.96
CCR10-202ENST00000591568 ADAMTS12P58397 1594 aa39.75■■■■□ 3.95
CCR10-202ENST00000591568 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.72■■■■□ 3.95
CCR10-202ENST00000591568 GRIN2AQ12879 1464 aa39.68■■■■□ 3.94
CCR10-202ENST00000591568 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.65■■■■□ 3.94
CCR10-202ENST00000591568 ARAP1Q96P48 1450 aa39.61■■■■□ 3.93
CCR10-202ENST00000591568 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.6■■■■□ 3.93
CCR10-202ENST00000591568 NUP160Q12769 1436 aa39.52■■■■□ 3.92
CCR10-202ENST00000591568 CEP170Q5SW79 1584 aa39.5■■■■□ 3.91
CCR10-202ENST00000591568 KIF27Q86VH2 1401 aa39.47■■■■□ 3.91
CCR10-202ENST00000591568 IGF1RP08069 1367 aa39.34■■■■□ 3.89
CCR10-202ENST00000591568 CUL7Q14999 1698 aa39.28■■■■□ 3.88
CCR10-202ENST00000591568 SHROOM2Q13796 1616 aa39.26■■■■□ 3.88
CCR10-202ENST00000591568 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.23■■■■□ 3.87
CCR10-202ENST00000591568 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.17■■■■□ 3.86
CCR10-202ENST00000591568 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.11■■■■□ 3.85
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