RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554791.5

CGRRF1-202, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CGRRF1, Length 719 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-202ENST00000554791 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.74■■■■■ 6.83
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CGRRF1-202ENST00000554791 NACADO15069 1562 aa49.09■■■■■ 5.45
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CGRRF1-202ENST00000554791 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.32■■■■■ 5.33
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CGRRF1-202ENST00000554791 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.01■■■■■ 5.12
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CGRRF1-202ENST00000554791 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.02■■■■■ 4.8
CGRRF1-202ENST00000554791 ERCC6Q03468 1493 aa45.02■■■■■ 4.8
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CGRRF1-202ENST00000554791 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.49■■■■■ 4.71
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CGRRF1-202ENST00000554791 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.1■■■■■ 4.65
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CGRRF1-202ENST00000554791 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.93■■■■■ 4.62
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CGRRF1-202ENST00000554791 WDR62O43379 1518 aa43.59■■■■■ 4.57
CGRRF1-202ENST00000554791 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.54■■■■■ 4.56
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CGRRF1-202ENST00000554791 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.46■■■■■ 4.55
CGRRF1-202ENST00000554791 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
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CGRRF1-202ENST00000554791 PRDM2Q13029 1718 aa42.99■■■■■ 4.47
CGRRF1-202ENST00000554791 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.91■■■■■ 4.46
CGRRF1-202ENST00000554791 OSCARQ8IYS5 282 aa42.86■■■■■ 4.45
CGRRF1-202ENST00000554791 IFT140Q96RY7 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
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CGRRF1-202ENST00000554791 ABCC8Q09428 1581 aa42.52■■■■■ 4.4
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CGRRF1-202ENST00000554791 FBLN2P98095 1184 aa42.04■■■■■ 4.32
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CGRRF1-202ENST00000554791 ARAP1Q96P48 1450 aa41.72■■■■■ 4.27
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CGRRF1-202ENST00000554791 SYNJ2O15056 1496 aa41.52■■■■■ 4.24
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CGRRF1-202ENST00000554791 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.39■■■■■ 4.22
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CGRRF1-202ENST00000554791 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
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CGRRF1-202ENST00000554791 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.11■■■■■ 4.17
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CGRRF1-202ENST00000554791 ADAMTS12P58397 1594 aa41.06■■■■■ 4.16
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CGRRF1-202ENST00000554791 NUP160Q12769 1436 aa40.93■■■■■ 4.14
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CGRRF1-202ENST00000554791 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.88■■■■■ 4.14
CGRRF1-202ENST00000554791 SHROOM2Q13796 1616 aa40.77■■■■■ 4.12
CGRRF1-202ENST00000554791 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
CGRRF1-202ENST00000554791 JPH4Q96JJ6 628 aa40.56■■■■■ 4.08
CGRRF1-202ENST00000554791 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.48■■■■■ 4.07
CGRRF1-202ENST00000554791 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
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