RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539963.1

AP001453.1-202, humanhuman

TSL 3

Gene AP001453.1, Length 227 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP001453.1-202ENST00000539963 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.63■■■■■ 7.14
AP001453.1-202ENST00000539963 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.41■■■■■ 6.14
AP001453.1-202ENST00000539963 ABCC9O60706 1549 aa53.16■■■■■ 6.1
AP001453.1-202ENST00000539963 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.72■■■■■ 5.71
AP001453.1-202ENST00000539963 NACADO15069 1562 aa50.43■■■■■ 5.66
AP001453.1-202ENST00000539963 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.28■■■■■ 5.64
AP001453.1-202ENST00000539963 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.8■■■■■ 5.56
AP001453.1-202ENST00000539963 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.56■■■■■ 5.52
AP001453.1-202ENST00000539963 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.54■■■■■ 5.52
AP001453.1-202ENST00000539963 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.54■■■■■ 5.52
AP001453.1-202ENST00000539963 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.48■■■■■ 5.51
AP001453.1-202ENST00000539963 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.27■■■■■ 5.48
AP001453.1-202ENST00000539963 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.19■■■■■ 5.46
AP001453.1-202ENST00000539963 SCRIBQ14160 1630 aa48.71■■■■■ 5.39
AP001453.1-202ENST00000539963 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.61■■■■■ 5.37
AP001453.1-202ENST00000539963 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.03■■■■■ 5.28
AP001453.1-202ENST00000539963 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
AP001453.1-202ENST00000539963 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.86■■■■■ 5.25
AP001453.1-202ENST00000539963 NCAPD3P42695 1498 aa46.54■■■■■ 5.04
AP001453.1-202ENST00000539963 SMARCA4P51532 1647 aa46.47■■■■■ 5.03
AP001453.1-202ENST00000539963 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.44■■■■■ 5.02
AP001453.1-202ENST00000539963 SMARCA2P51531 1590 aa46.35■■■■■ 5.01
AP001453.1-202ENST00000539963 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
AP001453.1-202ENST00000539963 HMGXB3Q12766 1538 aa46.23■■■■■ 4.99
AP001453.1-202ENST00000539963 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
AP001453.1-202ENST00000539963 PEG3Q9GZU2 1588 aa46■■■■■ 4.95
AP001453.1-202ENST00000539963 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.94■■■■■ 4.94
AP001453.1-202ENST00000539963 ERCC6Q03468 1493 aa45.93■■■■■ 4.94
AP001453.1-202ENST00000539963 NESP48681 1621 aa45.72■■■■■ 4.91
AP001453.1-202ENST00000539963 CUX2O14529 1486 aa45.72■■■■■ 4.91
AP001453.1-202ENST00000539963 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.46■■■■■ 4.87
AP001453.1-202ENST00000539963 WIZO95785 1651 aa45.41■■■■■ 4.86
AP001453.1-202ENST00000539963 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.36■■■■■ 4.85
AP001453.1-202ENST00000539963 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.22■■■■■ 4.83
AP001453.1-202ENST00000539963 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
AP001453.1-202ENST00000539963 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.15■■■■■ 4.82
AP001453.1-202ENST00000539963 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.15■■■■■ 4.82
AP001453.1-202ENST00000539963 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
AP001453.1-202ENST00000539963 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
AP001453.1-202ENST00000539963 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.8■■■■■ 4.76
AP001453.1-202ENST00000539963 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.69■■■■■ 4.74
AP001453.1-202ENST00000539963 CFTRP13569 1480 aa44.68■■■■■ 4.74
AP001453.1-202ENST00000539963 WDR62O43379 1518 aa44.67■■■■■ 4.74
AP001453.1-202ENST00000539963 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.65■■■■■ 4.74
AP001453.1-202ENST00000539963 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.35■■■■■ 4.69
AP001453.1-202ENST00000539963 PRDM2Q13029 1718 aa44.27■■■■■ 4.68
AP001453.1-202ENST00000539963 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
AP001453.1-202ENST00000539963 TOPBP1Q92547 1522 aa43.83■■■■■ 4.61
AP001453.1-202ENST00000539963 IFT140Q96RY7 1462 aa43.78■■■■■ 4.6
AP001453.1-202ENST00000539963 ABCC8Q09428 1581 aa43.77■■■■■ 4.6
AP001453.1-202ENST00000539963 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.7■■■■■ 4.59
AP001453.1-202ENST00000539963 OSCARQ8IYS5 282 aa43.68■■■■■ 4.58
AP001453.1-202ENST00000539963 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
AP001453.1-202ENST00000539963 TRIM41Q8WV44 630 aa43.53■■■■■ 4.56
AP001453.1-202ENST00000539963 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
AP001453.1-202ENST00000539963 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
AP001453.1-202ENST00000539963 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
AP001453.1-202ENST00000539963 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
AP001453.1-202ENST00000539963 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.31■■■■■ 4.52
AP001453.1-202ENST00000539963 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.23■■■■■ 4.51
AP001453.1-202ENST00000539963 SOGA1O94964 1423 aa43.22■■■■■ 4.51
AP001453.1-202ENST00000539963 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.17■■■■■ 4.5
AP001453.1-202ENST00000539963 CUX1P39880 1505 aa43.16■■■■■ 4.5
AP001453.1-202ENST00000539963 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
AP001453.1-202ENST00000539963 CHD1O14646 1710 aa43.08■■■■■ 4.49
AP001453.1-202ENST00000539963 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.07■■■■■ 4.48
AP001453.1-202ENST00000539963 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.07■■■■■ 4.48
AP001453.1-202ENST00000539963 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.07■■■■■ 4.48
AP001453.1-202ENST00000539963 FBLN2P98095 1184 aa43.02■■■■■ 4.48
AP001453.1-202ENST00000539963 WDR97A6NE52 1622 aa43.01■■■■■ 4.48
AP001453.1-202ENST00000539963 ARHGEF11O15085 1522 aa42.96■■■■■ 4.47
AP001453.1-202ENST00000539963 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.89■■■■■ 4.46
AP001453.1-202ENST00000539963 GRIN2BQ13224 1484 aa42.81■■■■■ 4.44
AP001453.1-202ENST00000539963 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
AP001453.1-202ENST00000539963 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
AP001453.1-202ENST00000539963 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.7■■■■■ 4.43
AP001453.1-202ENST00000539963 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.69■■■■■ 4.42
AP001453.1-202ENST00000539963 PBRM1Q86U86 1689 aa42.66■■■■■ 4.42
AP001453.1-202ENST00000539963 SYNJ2O15056 1496 aa42.64■■■■■ 4.42
AP001453.1-202ENST00000539963 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.64■■■■■ 4.42
AP001453.1-202ENST00000539963 SYNJ1O43426 1573 aa42.61■■■■■ 4.41
AP001453.1-202ENST00000539963 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.6■■■■■ 4.41
AP001453.1-202ENST00000539963 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.6■■■■■ 4.41
AP001453.1-202ENST00000539963 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.56■■■■■ 4.4
AP001453.1-202ENST00000539963 TOP2BQ02880 1626 aa42.55■■■■■ 4.4
AP001453.1-202ENST00000539963 ARAP1Q96P48 1450 aa42.55■■■■■ 4.4
AP001453.1-202ENST00000539963 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.54■■■■■ 4.4
AP001453.1-202ENST00000539963 ADAMTS12P58397 1594 aa42.27■■■■■ 4.36
AP001453.1-202ENST00000539963 GRIN2AQ12879 1464 aa42.25■■■■■ 4.35
AP001453.1-202ENST00000539963 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.17■■■■■ 4.34
AP001453.1-202ENST00000539963 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.16■■■■■ 4.34
AP001453.1-202ENST00000539963 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
AP001453.1-202ENST00000539963 NUP160Q12769 1436 aa42.09■■■■■ 4.33
AP001453.1-202ENST00000539963 CEP170Q5SW79 1584 aa42.08■■■■■ 4.33
AP001453.1-202ENST00000539963 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.92■■■■■ 4.3
AP001453.1-202ENST00000539963 SHROOM2Q13796 1616 aa41.87■■■■■ 4.29
AP001453.1-202ENST00000539963 KIF27Q86VH2 1401 aa41.76■■■■■ 4.28
AP001453.1-202ENST00000539963 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
AP001453.1-202ENST00000539963 IGF1RP08069 1367 aa41.67■■■■■ 4.26
AP001453.1-202ENST00000539963 JPH4Q96JJ6 628 aa41.67■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms