RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529931.1

EBAG9-205, Transcript of estrogen receptor binding site associated, antigen, 9, humanhuman

TSL 3

Gene EBAG9, Length 413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9-205ENST00000529931 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.28■■■■■ 6.76
EBAG9-205ENST00000529931 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.31■■■■■ 5.8
EBAG9-205ENST00000529931 ABCC9O60706 1549 aa50.57■■■■■ 5.69
EBAG9-205ENST00000529931 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.5■■■■■ 5.35
EBAG9-205ENST00000529931 NACADO15069 1562 aa48.29■■■■■ 5.32
EBAG9-205ENST00000529931 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.03■■■■■ 5.28
EBAG9-205ENST00000529931 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.8■■■■■ 5.24
EBAG9-205ENST00000529931 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
EBAG9-205ENST00000529931 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.47■■■■■ 5.19
EBAG9-205ENST00000529931 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.4■■■■■ 5.18
EBAG9-205ENST00000529931 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.09■■■■■ 5.13
EBAG9-205ENST00000529931 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.98■■■■■ 5.11
EBAG9-205ENST00000529931 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.76■■■■■ 5.08
EBAG9-205ENST00000529931 SCRIBQ14160 1630 aa46.7■■■■■ 5.07
EBAG9-205ENST00000529931 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.51■■■■■ 5.04
EBAG9-205ENST00000529931 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.81■■■■■ 4.92
EBAG9-205ENST00000529931 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.77■■■■■ 4.92
EBAG9-205ENST00000529931 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.51■■■■■ 4.88
EBAG9-205ENST00000529931 SMARCA4P51532 1647 aa44.62■■■■■ 4.73
EBAG9-205ENST00000529931 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
EBAG9-205ENST00000529931 NCAPD3P42695 1498 aa44.48■■■■■ 4.71
EBAG9-205ENST00000529931 SMARCA2P51531 1590 aa44.44■■■■■ 4.71
EBAG9-205ENST00000529931 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.43■■■■■ 4.7
EBAG9-205ENST00000529931 HMGXB3Q12766 1538 aa44.3■■■■■ 4.68
EBAG9-205ENST00000529931 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.17■■■■■ 4.66
EBAG9-205ENST00000529931 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.11■■■■■ 4.65
EBAG9-205ENST00000529931 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
EBAG9-205ENST00000529931 ERCC6Q03468 1493 aa43.7■■■■■ 4.59
EBAG9-205ENST00000529931 WIZO95785 1651 aa43.68■■■■■ 4.58
EBAG9-205ENST00000529931 NESP48681 1621 aa43.59■■■■■ 4.57
EBAG9-205ENST00000529931 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.5■■■■■ 4.55
EBAG9-205ENST00000529931 CUX2O14529 1486 aa43.42■■■■■ 4.54
EBAG9-205ENST00000529931 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
EBAG9-205ENST00000529931 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.19■■■■■ 4.5
EBAG9-205ENST00000529931 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
EBAG9-205ENST00000529931 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.17■■■■■ 4.5
EBAG9-205ENST00000529931 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.16■■■■■ 4.5
EBAG9-205ENST00000529931 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
EBAG9-205ENST00000529931 CFTRP13569 1480 aa42.81■■■■■ 4.44
EBAG9-205ENST00000529931 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.77■■■■■ 4.44
EBAG9-205ENST00000529931 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.74■■■■■ 4.43
EBAG9-205ENST00000529931 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.7■■■■■ 4.43
EBAG9-205ENST00000529931 PRDM2Q13029 1718 aa42.66■■■■■ 4.42
EBAG9-205ENST00000529931 WDR62O43379 1518 aa42.66■■■■■ 4.42
EBAG9-205ENST00000529931 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.61■■■■■ 4.41
EBAG9-205ENST00000529931 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.6■■■■■ 4.41
EBAG9-205ENST00000529931 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
EBAG9-205ENST00000529931 ABCC8Q09428 1581 aa41.97■■■■■ 4.31
EBAG9-205ENST00000529931 TOPBP1Q92547 1522 aa41.96■■■■■ 4.31
EBAG9-205ENST00000529931 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.92■■■■■ 4.3
EBAG9-205ENST00000529931 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
EBAG9-205ENST00000529931 IFT140Q96RY7 1462 aa41.84■■■■■ 4.29
EBAG9-205ENST00000529931 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
EBAG9-205ENST00000529931 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
EBAG9-205ENST00000529931 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
EBAG9-205ENST00000529931 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
EBAG9-205ENST00000529931 OSCARQ8IYS5 282 aa41.45■■■■■ 4.23
EBAG9-205ENST00000529931 CUX1P39880 1505 aa41.44■■■■■ 4.22
EBAG9-205ENST00000529931 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
EBAG9-205ENST00000529931 SOGA1O94964 1423 aa41.36■■■■■ 4.21
EBAG9-205ENST00000529931 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.35■■■■■ 4.21
EBAG9-205ENST00000529931 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
EBAG9-205ENST00000529931 WDR97A6NE52 1622 aa41.29■■■■■ 4.2
EBAG9-205ENST00000529931 CHD1O14646 1710 aa41.2■■■■■ 4.19
EBAG9-205ENST00000529931 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
EBAG9-205ENST00000529931 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.03■■■■■ 4.16
EBAG9-205ENST00000529931 TRIM41Q8WV44 630 aa41.01■■■■■ 4.16
EBAG9-205ENST00000529931 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41■■■■■ 4.15
EBAG9-205ENST00000529931 TOP2BQ02880 1626 aa41■■■■■ 4.15
EBAG9-205ENST00000529931 PBRM1Q86U86 1689 aa40.98■■■■■ 4.15
EBAG9-205ENST00000529931 GRIN2BQ13224 1484 aa40.98■■■■■ 4.15
EBAG9-205ENST00000529931 FBLN2P98095 1184 aa40.97■■■■■ 4.15
EBAG9-205ENST00000529931 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.97■■■■■ 4.15
EBAG9-205ENST00000529931 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.97■■■■■ 4.15
EBAG9-205ENST00000529931 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
EBAG9-205ENST00000529931 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.94■■■■■ 4.14
EBAG9-205ENST00000529931 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.94■■■■■ 4.14
EBAG9-205ENST00000529931 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.94■■■■■ 4.14
EBAG9-205ENST00000529931 SYNJ1O43426 1573 aa40.92■■■■■ 4.14
EBAG9-205ENST00000529931 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.9■■■■■ 4.14
EBAG9-205ENST00000529931 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.89■■■■■ 4.14
EBAG9-205ENST00000529931 ARHGEF11O15085 1522 aa40.83■■■■■ 4.13
EBAG9-205ENST00000529931 SYNJ2O15056 1496 aa40.78■■■■■ 4.12
EBAG9-205ENST00000529931 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
EBAG9-205ENST00000529931 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.65■■■■■ 4.1
EBAG9-205ENST00000529931 ADAMTS12P58397 1594 aa40.55■■■■■ 4.08
EBAG9-205ENST00000529931 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.51■■■■■ 4.08
EBAG9-205ENST00000529931 GRIN2AQ12879 1464 aa40.45■■■■■ 4.07
EBAG9-205ENST00000529931 ARAP1Q96P48 1450 aa40.45■■■■■ 4.07
EBAG9-205ENST00000529931 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.42■■■■■ 4.06
EBAG9-205ENST00000529931 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.41■■■■■ 4.06
EBAG9-205ENST00000529931 CEP170Q5SW79 1584 aa40.28■■■■■ 4.04
EBAG9-205ENST00000529931 NUP160Q12769 1436 aa40.26■■■■■ 4.04
EBAG9-205ENST00000529931 KIF27Q86VH2 1401 aa40.17■■■■■ 4.02
EBAG9-205ENST00000529931 CUL7Q14999 1698 aa40.1■■■■■ 4.01
EBAG9-205ENST00000529931 SHROOM2Q13796 1616 aa40.09■■■■■ 4.01
EBAG9-205ENST00000529931 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40■■■■□ 3.99
EBAG9-205ENST00000529931 IGF1RP08069 1367 aa39.99■■■■□ 3.99
EBAG9-205ENST00000529931 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.96■■■■□ 3.99
EBAG9-205ENST00000529931 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms