RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523980.1

ARHGEF10-214, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

TSL 4

Gene ARHGEF10, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10-214ENST00000523980 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.83■■■■■ 5.41
ARHGEF10-214ENST00000523980 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.37■■■■■ 4.53
ARHGEF10-214ENST00000523980 ABCC9O60706 1549 aa42.86■■■■■ 4.45
ARHGEF10-214ENST00000523980 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.1■■■■■ 4.17
ARHGEF10-214ENST00000523980 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41■■■■■ 4.15
ARHGEF10-214ENST00000523980 NACADO15069 1562 aa40.91■■■■■ 4.14
ARHGEF10-214ENST00000523980 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
ARHGEF10-214ENST00000523980 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.55■■■■■ 4.08
ARHGEF10-214ENST00000523980 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.32■■■■■ 4.04
ARHGEF10-214ENST00000523980 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.11■■■■■ 4.01
ARHGEF10-214ENST00000523980 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.04■■■■■ 4
ARHGEF10-214ENST00000523980 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.82■■■■□ 3.97
ARHGEF10-214ENST00000523980 SCRIBQ14160 1630 aa39.69■■■■□ 3.94
ARHGEF10-214ENST00000523980 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.64■■■■□ 3.94
ARHGEF10-214ENST00000523980 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.25■■■■□ 3.87
ARHGEF10-214ENST00000523980 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
ARHGEF10-214ENST00000523980 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.68■■■■□ 3.78
ARHGEF10-214ENST00000523980 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.5■■■■□ 3.75
ARHGEF10-214ENST00000523980 SMARCA4P51532 1647 aa37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF10-214ENST00000523980 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.65
ARHGEF10-214ENST00000523980 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.81■■■■□ 3.64
ARHGEF10-214ENST00000523980 NCAPD3P42695 1498 aa37.8■■■■□ 3.64
ARHGEF10-214ENST00000523980 SMARCA2P51531 1590 aa37.69■■■■□ 3.62
ARHGEF10-214ENST00000523980 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.68■■■■□ 3.62
ARHGEF10-214ENST00000523980 HMGXB3Q12766 1538 aa37.52■■■■□ 3.6
ARHGEF10-214ENST00000523980 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.49■■■■□ 3.59
ARHGEF10-214ENST00000523980 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
ARHGEF10-214ENST00000523980 WIZO95785 1651 aa37.22■■■■□ 3.55
ARHGEF10-214ENST00000523980 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
ARHGEF10-214ENST00000523980 NESP48681 1621 aa37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF10-214ENST00000523980 ERCC6Q03468 1493 aa36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF10-214ENST00000523980 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
ARHGEF10-214ENST00000523980 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.78■■■■□ 3.48
ARHGEF10-214ENST00000523980 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.73■■■■□ 3.47
ARHGEF10-214ENST00000523980 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.6■■■■□ 3.45
ARHGEF10-214ENST00000523980 CUX2O14529 1486 aa36.54■■■■□ 3.44
ARHGEF10-214ENST00000523980 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.48■■■■□ 3.43
ARHGEF10-214ENST00000523980 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF10-214ENST00000523980 CFTRP13569 1480 aa36.43■■■■□ 3.42
ARHGEF10-214ENST00000523980 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF10-214ENST00000523980 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF10-214ENST00000523980 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF10-214ENST00000523980 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF10-214ENST00000523980 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF10-214ENST00000523980 WDR62O43379 1518 aa36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF10-214ENST00000523980 PRDM2Q13029 1718 aa35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF10-214ENST00000523980 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF10-214ENST00000523980 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF10-214ENST00000523980 TOPBP1Q92547 1522 aa35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF10-214ENST00000523980 ABCC8Q09428 1581 aa35.6■■■■□ 3.29
ARHGEF10-214ENST00000523980 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF10-214ENST00000523980 IFT140Q96RY7 1462 aa35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF10-214ENST00000523980 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
ARHGEF10-214ENST00000523980 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF10-214ENST00000523980 CUX1P39880 1505 aa35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF10-214ENST00000523980 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF10-214ENST00000523980 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF10-214ENST00000523980 SOGA1O94964 1423 aa35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF10-214ENST00000523980 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF10-214ENST00000523980 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF10-214ENST00000523980 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF10-214ENST00000523980 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF10-214ENST00000523980 OSCARQ8IYS5 282 aa35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF10-214ENST00000523980 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.2
ARHGEF10-214ENST00000523980 SYNJ1O43426 1573 aa34.93■■■■□ 3.18
ARHGEF10-214ENST00000523980 TOP2BQ02880 1626 aa34.92■■■■□ 3.18
ARHGEF10-214ENST00000523980 FBLN2P98095 1184 aa34.89■■■■□ 3.18
ARHGEF10-214ENST00000523980 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.88■■■■□ 3.17
ARHGEF10-214ENST00000523980 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.87■■■■□ 3.17
ARHGEF10-214ENST00000523980 WDR97A6NE52 1622 aa34.87■■■■□ 3.17
ARHGEF10-214ENST00000523980 GRIN2BQ13224 1484 aa34.82■■■■□ 3.16
ARHGEF10-214ENST00000523980 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.82■■■■□ 3.16
ARHGEF10-214ENST00000523980 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.82■■■■□ 3.16
ARHGEF10-214ENST00000523980 CHD1O14646 1710 aa34.75■■■■□ 3.15
ARHGEF10-214ENST00000523980 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF10-214ENST00000523980 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
ARHGEF10-214ENST00000523980 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.7■■■■□ 3.15
ARHGEF10-214ENST00000523980 PBRM1Q86U86 1689 aa34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF10-214ENST00000523980 SYNJ2O15056 1496 aa34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF10-214ENST00000523980 TRIM41Q8WV44 630 aa34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF10-214ENST00000523980 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF10-214ENST00000523980 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF10-214ENST00000523980 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF10-214ENST00000523980 ARHGEF11O15085 1522 aa34.46■■■■□ 3.11
ARHGEF10-214ENST00000523980 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF10-214ENST00000523980 ADAMTS12P58397 1594 aa34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF10-214ENST00000523980 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF10-214ENST00000523980 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF10-214ENST00000523980 GRIN2AQ12879 1464 aa34.37■■■■□ 3.09
ARHGEF10-214ENST00000523980 KIF27Q86VH2 1401 aa34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF10-214ENST00000523980 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.29■■■■□ 3.08
ARHGEF10-214ENST00000523980 IGF1RP08069 1367 aa34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF10-214ENST00000523980 NUP160Q12769 1436 aa34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF10-214ENST00000523980 CEP170Q5SW79 1584 aa34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF10-214ENST00000523980 ARAP1Q96P48 1450 aa34.2■■■■□ 3.06
ARHGEF10-214ENST00000523980 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF10-214ENST00000523980 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF10-214ENST00000523980 CUL7Q14999 1698 aa34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF10-214ENST00000523980 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF10-214ENST00000523980 JPH4Q96JJ6 628 aa33.97■■■■□ 3.03
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