RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520432.1

TPT1-AS1-208, TPT1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TPT1-AS1, Length 897 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPT1-AS1-208ENST00000520432 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.82■■■■□ 3.32
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ABCC9O60706 1549 aa32.13■■■□□ 2.73
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32■■■□□ 2.71
TPT1-AS1-208ENST00000520432 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.54■■■□□ 2.48
TPT1-AS1-208ENST00000520432 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.47■■■□□ 2.47
TPT1-AS1-208ENST00000520432 NACADO15069 1562 aa30.33■■■□□ 2.45
TPT1-AS1-208ENST00000520432 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.16■■■□□ 2.42
TPT1-AS1-208ENST00000520432 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.45e-8■■■□□ 15.8
TPT1-AS1-208ENST00000520432 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.9■■■□□ 2.38
TPT1-AS1-208ENST00000520432 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.7■■■□□ 2.34
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TPT1-AS1-208ENST00000520432 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.6■■■□□ 2.33
TPT1-AS1-208ENST00000520432 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.54■■■□□ 2.32
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SCRIBQ14160 1630 aa29.26■■■□□ 2.27
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.21■■■□□ 2.27
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.95■■■□□ 2.23
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.94■■■□□ 2.22
TPT1-AS1-208ENST00000520432 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TPT1-AS1-208ENST00000520432 NCAPD3P42695 1498 aa28.05■■■□□ 2.08
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.96■■■□□ 2.07
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SMARCA4P51532 1647 aa27.89■■■□□ 2.05
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SMARCA2P51531 1590 aa27.86■■■□□ 2.05
TPT1-AS1-208ENST00000520432 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
TPT1-AS1-208ENST00000520432 HMGXB3Q12766 1538 aa27.77■■■□□ 2.04
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ERCC6Q03468 1493 aa27.76■■■□□ 2.04
TPT1-AS1-208ENST00000520432 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
TPT1-AS1-208ENST00000520432 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.67■■■□□ 2.02
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CUX2O14529 1486 aa27.63■■■□□ 2.01
TPT1-AS1-208ENST00000520432 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.6■■■□□ 2.01
TPT1-AS1-208ENST00000520432 NESP48681 1621 aa27.59■■■□□ 2.01
TPT1-AS1-208ENST00000520432 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.59■■■□□ 2.01
TPT1-AS1-208ENST00000520432 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.35■■□□□ 1.97
TPT1-AS1-208ENST00000520432 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.3■■□□□ 1.96
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.24■■□□□ 1.95
TPT1-AS1-208ENST00000520432 WIZO95785 1651 aa27.24■■□□□ 1.95
TPT1-AS1-208ENST00000520432 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TPT1-AS1-208ENST00000520432 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.13■■□□□ 1.93
TPT1-AS1-208ENST00000520432 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TPT1-AS1-208ENST00000520432 MRC2Q9UBG0 1479 aa27■■□□□ 1.91
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.91■■□□□ 1.9
TPT1-AS1-208ENST00000520432 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TPT1-AS1-208ENST00000520432 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.9■■□□□ 1.9
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CFTRP13569 1480 aa26.89■■□□□ 1.9
TPT1-AS1-208ENST00000520432 WDR62O43379 1518 aa26.88■■□□□ 1.89
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.67■■□□□ 1.86
TPT1-AS1-208ENST00000520432 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TPT1-AS1-208ENST00000520432 TRIM41Q8WV44 630 aa26.54■■□□□ 1.84
TPT1-AS1-208ENST00000520432 OSCARQ8IYS5 282 aa26.52■■□□□ 1.84
TPT1-AS1-208ENST00000520432 PRDM2Q13029 1718 aa26.43■■□□□ 1.82
TPT1-AS1-208ENST00000520432 IFT140Q96RY7 1462 aa26.38■■□□□ 1.81
TPT1-AS1-208ENST00000520432 TOPBP1Q92547 1522 aa26.37■■□□□ 1.81
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ABCC8Q09428 1581 aa26.34■■□□□ 1.81
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
TPT1-AS1-208ENST00000520432 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.24■■□□□ 1.79
TPT1-AS1-208ENST00000520432 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
TPT1-AS1-208ENST00000520432 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TPT1-AS1-208ENST00000520432 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TPT1-AS1-208ENST00000520432 FBLN2P98095 1184 aa26.09■■□□□ 1.77
TPT1-AS1-208ENST00000520432 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SOGA1O94964 1423 aa26.07■■□□□ 1.76
TPT1-AS1-208ENST00000520432 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.05■■□□□ 1.76
TPT1-AS1-208ENST00000520432 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
TPT1-AS1-208ENST00000520432 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.99■■□□□ 1.75
TPT1-AS1-208ENST00000520432 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.99■■□□□ 1.75
TPT1-AS1-208ENST00000520432 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.99■■□□□ 1.75
TPT1-AS1-208ENST00000520432 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.96■■□□□ 1.75
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ARHGEF11O15085 1522 aa25.95■■□□□ 1.74
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.92■■□□□ 1.74
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CUX1P39880 1505 aa25.92■■□□□ 1.74
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CHD1O14646 1710 aa25.88■■□□□ 1.73
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.84■■□□□ 1.73
TPT1-AS1-208ENST00000520432 WDR97A6NE52 1622 aa25.79■■□□□ 1.72
TPT1-AS1-208ENST00000520432 GRIN2BQ13224 1484 aa25.79■■□□□ 1.72
TPT1-AS1-208ENST00000520432 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TPT1-AS1-208ENST00000520432 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.72■■□□□ 1.71
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ARAP1Q96P48 1450 aa25.7■■□□□ 1.7
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SYNJ2O15056 1496 aa25.68■■□□□ 1.7
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.65■■□□□ 1.7
TPT1-AS1-208ENST00000520432 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SYNJ1O43426 1573 aa25.65■■□□□ 1.7
TPT1-AS1-208ENST00000520432 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.62■■□□□ 1.69
TPT1-AS1-208ENST00000520432 PBRM1Q86U86 1689 aa25.55■■□□□ 1.68
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.54■■□□□ 1.68
TPT1-AS1-208ENST00000520432 TOP2BQ02880 1626 aa25.49■■□□□ 1.67
TPT1-AS1-208ENST00000520432 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.45■■□□□ 1.66
TPT1-AS1-208ENST00000520432 GRIN2AQ12879 1464 aa25.43■■□□□ 1.66
TPT1-AS1-208ENST00000520432 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.39■■□□□ 1.66
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ADAMTS12P58397 1594 aa25.35■■□□□ 1.65
TPT1-AS1-208ENST00000520432 NUP160Q12769 1436 aa25.34■■□□□ 1.65
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.32■■□□□ 1.64
TPT1-AS1-208ENST00000520432 CEP170Q5SW79 1584 aa25.3■■□□□ 1.64
TPT1-AS1-208ENST00000520432 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.26■■□□□ 1.63
TPT1-AS1-208ENST00000520432 JPH4Q96JJ6 628 aa25.21■■□□□ 1.63
TPT1-AS1-208ENST00000520432 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TPT1-AS1-208ENST00000520432 SHROOM2Q13796 1616 aa25.14■■□□□ 1.61
TPT1-AS1-208ENST00000520432 IGF1RP08069 1367 aa25.11■■□□□ 1.61
TPT1-AS1-208ENST00000520432 KIF27Q86VH2 1401 aa25.1■■□□□ 1.61
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