RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498151.1

PRMT2-215, Transcript of protein arginine methyltransferase 2, human

TSL 3

Gene PRMT2, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT2-215	ENST00000498151	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.89	■■■■■ 6.7
PRMT2-215	ENST00000498151	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.91	■■■■■ 5.74
PRMT2-215	ENST00000498151	ABCC9	O60706	1549 aa		50.62	■■■■■ 5.69
PRMT2-215	ENST00000498151	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.29	■■■■■ 5.32
PRMT2-215	ENST00000498151	NACAD	O15069	1562 aa		48.02	■■■■■ 5.28
PRMT2-215	ENST00000498151	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.95	■■■■■ 5.27
PRMT2-215	ENST00000498151	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.41	■■■■■ 5.18
PRMT2-215	ENST00000498151	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47.27	■■■■■ 5.16
PRMT2-215	ENST00000498151	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.24	■■■■■ 5.15
PRMT2-215	ENST00000498151	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.18	■■■■■ 5.14
PRMT2-215	ENST00000498151	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		47.11	■■■■■ 5.13
PRMT2-215	ENST00000498151	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.96	■■■■■ 5.11
PRMT2-215	ENST00000498151	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.87	■■■■■ 5.09
PRMT2-215	ENST00000498151	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.5	■■■■■ 5.04
PRMT2-215	ENST00000498151	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.2	■■■■■ 4.99
PRMT2-215	ENST00000498151	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.73	■■■■■ 4.91
PRMT2-215	ENST00000498151	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.71	■■■■■ 4.91
PRMT2-215	ENST00000498151	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.53	■■■■■ 4.88
PRMT2-215	ENST00000498151	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.34	■■■■■ 4.69
PRMT2-215	ENST00000498151	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.3	■■■■■ 4.68
PRMT2-215	ENST00000498151	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.26	■■■■■ 4.68
PRMT2-215	ENST00000498151	SMARCA2	P51531	1590 aa		44.16	■■■■■ 4.66
PRMT2-215	ENST00000498151	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.15	■■■■■ 4.66
PRMT2-215	ENST00000498151	HMGXB3	Q12766	1538 aa		44.04	■■■■■ 4.64
PRMT2-215	ENST00000498151	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.89	■■■■■ 4.62
PRMT2-215	ENST00000498151	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.88	■■■■■ 4.61
PRMT2-215	ENST00000498151	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.84	■■■■■ 4.61
PRMT2-215	ENST00000498151	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.68	■■■■■ 4.58
PRMT2-215	ENST00000498151	NES	P48681	1621 aa		43.59	■■■■■ 4.57
PRMT2-215	ENST00000498151	WIZ	O95785	1651 aa		43.4	■■■■■ 4.54
PRMT2-215	ENST00000498151	CUX2	O14529	1486 aa		43.4	■■■■■ 4.54
PRMT2-215	ENST00000498151	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.29	■■■■■ 4.52
PRMT2-215	ENST00000498151	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.07	■■■■■ 4.49
PRMT2-215	ENST00000498151	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.06	■■■■■ 4.48
PRMT2-215	ENST00000498151	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
PRMT2-215	ENST00000498151	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.01	■■■■■ 4.48
PRMT2-215	ENST00000498151	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PRMT2-215	ENST00000498151	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.95	■■■■■ 4.47
PRMT2-215	ENST00000498151	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.84	■■■■■ 4.45
PRMT2-215	ENST00000498151	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.65	■■■■■ 4.42
PRMT2-215	ENST00000498151	CFTR	P13569	1480 aa		42.58	■■■■■ 4.41
PRMT2-215	ENST00000498151	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.57	■■■■■ 4.41
PRMT2-215	ENST00000498151	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PRMT2-215	ENST00000498151	WDR62	O43379	1518 aa		42.53	■■■■■ 4.4
PRMT2-215	ENST00000498151	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.35	■■■■■ 4.37
PRMT2-215	ENST00000498151	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.26	■■■■■ 4.36
PRMT2-215	ENST00000498151	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
PRMT2-215	ENST00000498151	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.78	■■■■■ 4.28
PRMT2-215	ENST00000498151	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.67	■■■■■ 4.26
PRMT2-215	ENST00000498151	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.67	■■■■■ 4.26
PRMT2-215	ENST00000498151	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PRMT2-215	ENST00000498151	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.61	■■■■■ 4.25
PRMT2-215	ENST00000498151	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.51	■■■■■ 4.24
PRMT2-215	ENST00000498151	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.48	■■■■■ 4.23
PRMT2-215	ENST00000498151	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.42	■■■■■ 4.22
PRMT2-215	ENST00000498151	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.38	■■■■■ 4.21
PRMT2-215	ENST00000498151	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.38	■■■■■ 4.21
PRMT2-215	ENST00000498151	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.34	■■■■■ 4.21
PRMT2-215	ENST00000498151	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.28	■■■■■ 4.2	2e-6	■■■■□ 20.3
PRMT2-215	ENST00000498151	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.25	■■■■■ 4.19
PRMT2-215	ENST00000498151	CUX1	P39880	1505 aa		41.21	■■■■■ 4.19
PRMT2-215	ENST00000498151	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.19	■■■■■ 4.18
PRMT2-215	ENST00000498151	SOGA1	O94964	1423 aa		41.18	■■■■■ 4.18
PRMT2-215	ENST00000498151	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.08	■■■■■ 4.17
PRMT2-215	ENST00000498151	CHD1	O14646	1710 aa		41.07	■■■■■ 4.17
PRMT2-215	ENST00000498151	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PRMT2-215	ENST00000498151	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PRMT2-215	ENST00000498151	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PRMT2-215	ENST00000498151	FBLN2	P98095	1184 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PRMT2-215	ENST00000498151	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.94	■■■■■ 4.14
PRMT2-215	ENST00000498151	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.89	■■■■■ 4.14
PRMT2-215	ENST00000498151	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.86	■■■■■ 4.13
PRMT2-215	ENST00000498151	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.78	■■■■■ 4.12
PRMT2-215	ENST00000498151	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
PRMT2-215	ENST00000498151	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PRMT2-215	ENST00000498151	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.7	■■■■■ 4.11
PRMT2-215	ENST00000498151	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.7	■■■■■ 4.11
PRMT2-215	ENST00000498151	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
PRMT2-215	ENST00000498151	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.65	■■■■■ 4.1
PRMT2-215	ENST00000498151	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PRMT2-215	ENST00000498151	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PRMT2-215	ENST00000498151	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PRMT2-215	ENST00000498151	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.63	■■■■■ 4.09
PRMT2-215	ENST00000498151	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PRMT2-215	ENST00000498151	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PRMT2-215	ENST00000498151	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PRMT2-215	ENST00000498151	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.49	■■■■■ 4.07
PRMT2-215	ENST00000498151	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PRMT2-215	ENST00000498151	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PRMT2-215	ENST00000498151	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PRMT2-215	ENST00000498151	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PRMT2-215	ENST00000498151	CEP170	Q5SW79	1584 aa		40.14	■■■■■ 4.02
PRMT2-215	ENST00000498151	NUP160	Q12769	1436 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PRMT2-215	ENST00000498151	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	40.01	■■■■■ 4
PRMT2-215	ENST00000498151	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PRMT2-215	ENST00000498151	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.9	■■■■□ 3.98
PRMT2-215	ENST00000498151	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.83	■■■■□ 3.97
PRMT2-215	ENST00000498151	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.75	■■■■□ 3.95
PRMT2-215	ENST00000498151	IGF1R	P08069	1367 aa		39.75	■■■■□ 3.95
PRMT2-215	ENST00000498151	CUL7	Q14999	1698 aa		39.72	■■■■□ 3.95

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