RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493099.1

GUCD1-212, Transcript of guanylyl cyclase domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene GUCD1, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1-212ENST00000493099 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.99■■■■■ 4.15
GUCD1-212ENST00000493099 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.55■■■■□ 3.44
GUCD1-212ENST00000493099 ABCC9O60706 1549 aa35.75■■■■□ 3.31
GUCD1-212ENST00000493099 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.44■■■■□ 3.1
GUCD1-212ENST00000493099 NACADO15069 1562 aa34.37■■■■□ 3.09
GUCD1-212ENST00000493099 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.24■■■■□ 3.07
GUCD1-212ENST00000493099 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.17■■■■□ 3.06
GUCD1-212ENST00000493099 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
GUCD1-212ENST00000493099 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.97■■■■□ 3.03
GUCD1-212ENST00000493099 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.59■■■□□ 2.97
GUCD1-212ENST00000493099 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.36■■■□□ 2.93
GUCD1-212ENST00000493099 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.32■■■□□ 2.92
GUCD1-212ENST00000493099 SCRIBQ14160 1630 aa33.26■■■□□ 2.91
GUCD1-212ENST00000493099 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.11■■■□□ 2.89
GUCD1-212ENST00000493099 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.83■■■□□ 2.85
GUCD1-212ENST00000493099 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
GUCD1-212ENST00000493099 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.36■■■□□ 2.77
GUCD1-212ENST00000493099 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.17■■■□□ 2.74
GUCD1-212ENST00000493099 SMARCA4P51532 1647 aa31.84■■■□□ 2.69
GUCD1-212ENST00000493099 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
GUCD1-212ENST00000493099 NCAPD3P42695 1498 aa31.7■■■□□ 2.66
GUCD1-212ENST00000493099 SMARCA2P51531 1590 aa31.69■■■□□ 2.66
GUCD1-212ENST00000493099 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.67■■■□□ 2.66
GUCD1-212ENST00000493099 HMGXB3Q12766 1538 aa31.56■■■□□ 2.64
GUCD1-212ENST00000493099 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.56■■■□□ 2.64
GUCD1-212ENST00000493099 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.55■■■□□ 2.64
GUCD1-212ENST00000493099 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
GUCD1-212ENST00000493099 WIZO95785 1651 aa31.21■■■□□ 2.59
GUCD1-212ENST00000493099 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
GUCD1-212ENST00000493099 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
GUCD1-212ENST00000493099 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.9■■■□□ 2.54
GUCD1-212ENST00000493099 NESP48681 1621 aa30.89■■■□□ 2.54
GUCD1-212ENST00000493099 ERCC6Q03468 1493 aa30.89■■■□□ 2.53
GUCD1-212ENST00000493099 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.76■■■□□ 2.51
GUCD1-212ENST00000493099 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.7■■■□□ 2.5
GUCD1-212ENST00000493099 CUX2O14529 1486 aa30.62■■■□□ 2.49
GUCD1-212ENST00000493099 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.56■■■□□ 2.48
GUCD1-212ENST00000493099 CFTRP13569 1480 aa30.56■■■□□ 2.48
GUCD1-212ENST00000493099 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.52■■■□□ 2.48
GUCD1-212ENST00000493099 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
GUCD1-212ENST00000493099 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.4■■■□□ 2.46
GUCD1-212ENST00000493099 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.4■■■□□ 2.46
GUCD1-212ENST00000493099 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.37■■■□□ 2.45
GUCD1-212ENST00000493099 PRDM2Q13029 1718 aa30.36■■■□□ 2.45
GUCD1-212ENST00000493099 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
GUCD1-212ENST00000493099 WDR62O43379 1518 aa30.27■■■□□ 2.44
GUCD1-212ENST00000493099 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GUCD1-212ENST00000493099 ABCC8Q09428 1581 aa29.97■■■□□ 2.39
GUCD1-212ENST00000493099 TOPBP1Q92547 1522 aa29.91■■■□□ 2.38
GUCD1-212ENST00000493099 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.88■■■□□ 2.37
GUCD1-212ENST00000493099 IFT140Q96RY7 1462 aa29.77■■■□□ 2.36
GUCD1-212ENST00000493099 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.72■■■□□ 2.35
GUCD1-212ENST00000493099 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
GUCD1-212ENST00000493099 CUX1P39880 1505 aa29.62■■■□□ 2.33
GUCD1-212ENST00000493099 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
GUCD1-212ENST00000493099 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
GUCD1-212ENST00000493099 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.55■■■□□ 2.32
GUCD1-212ENST00000493099 SOGA1O94964 1423 aa29.52■■■□□ 2.32
GUCD1-212ENST00000493099 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
GUCD1-212ENST00000493099 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.47■■■□□ 2.31
GUCD1-212ENST00000493099 WDR97A6NE52 1622 aa29.43■■■□□ 2.3
GUCD1-212ENST00000493099 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
GUCD1-212ENST00000493099 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.35e-6■■■□□ 18.9
GUCD1-212ENST00000493099 TOP2BQ02880 1626 aa29.38■■■□□ 2.29
GUCD1-212ENST00000493099 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.38■■■□□ 2.29
GUCD1-212ENST00000493099 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
GUCD1-212ENST00000493099 SYNJ1O43426 1573 aa29.32■■■□□ 2.28
GUCD1-212ENST00000493099 OSCARQ8IYS5 282 aa29.3■■■□□ 2.28
GUCD1-212ENST00000493099 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.29■■■□□ 2.28
GUCD1-212ENST00000493099 GRIN2BQ13224 1484 aa29.22■■■□□ 2.27
GUCD1-212ENST00000493099 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.19■■■□□ 2.26
GUCD1-212ENST00000493099 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
GUCD1-212ENST00000493099 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.16■■■□□ 2.26
GUCD1-212ENST00000493099 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.15■■■□□ 2.26
GUCD1-212ENST00000493099 PBRM1Q86U86 1689 aa29.13■■■□□ 2.25
GUCD1-212ENST00000493099 CHD1O14646 1710 aa29.13■■■□□ 2.25
GUCD1-212ENST00000493099 FBLN2P98095 1184 aa29.09■■■□□ 2.25
GUCD1-212ENST00000493099 SYNJ2O15056 1496 aa29.04■■■□□ 2.24
GUCD1-212ENST00000493099 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
GUCD1-212ENST00000493099 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.95■■■□□ 2.23
GUCD1-212ENST00000493099 ADAMTS12P58397 1594 aa28.9■■■□□ 2.22
GUCD1-212ENST00000493099 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
GUCD1-212ENST00000493099 KIF27Q86VH2 1401 aa28.85■■■□□ 2.21
GUCD1-212ENST00000493099 GRIN2AQ12879 1464 aa28.83■■■□□ 2.21
GUCD1-212ENST00000493099 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.82■■■□□ 2.2
GUCD1-212ENST00000493099 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.81■■■□□ 2.2
GUCD1-212ENST00000493099 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.81■■■□□ 2.2
GUCD1-212ENST00000493099 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.81■■■□□ 2.2
GUCD1-212ENST00000493099 ARHGEF11O15085 1522 aa28.81■■■□□ 2.2
GUCD1-212ENST00000493099 NUP160Q12769 1436 aa28.69■■■□□ 2.18
GUCD1-212ENST00000493099 IGF1RP08069 1367 aa28.69■■■□□ 2.18
GUCD1-212ENST00000493099 CUL7Q14999 1698 aa28.69■■■□□ 2.18
GUCD1-212ENST00000493099 TRIM41Q8WV44 630 aa28.68■■■□□ 2.18
GUCD1-212ENST00000493099 CEP170Q5SW79 1584 aa28.66■■■□□ 2.18
GUCD1-212ENST00000493099 ARAP1Q96P48 1450 aa28.55■■■□□ 2.16
GUCD1-212ENST00000493099 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.53■■■□□ 2.16
GUCD1-212ENST00000493099 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.52■■■□□ 2.16
GUCD1-212ENST00000493099 SHROOM2Q13796 1616 aa28.5■■■□□ 2.15
GUCD1-212ENST00000493099 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.48■■■□□ 2.15
GUCD1-212ENST00000493099 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.6 ms