RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485013.1

GAD1-212, Transcript of glutamate decarboxylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GAD1, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1-212ENST00000485013 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.62■■■■■ 6.49
GAD1-212ENST00000485013 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.57■■■■■ 5.53
GAD1-212ENST00000485013 ABCC9O60706 1549 aa49.08■■■■■ 5.45
GAD1-212ENST00000485013 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.94■■■■■ 5.1
GAD1-212ENST00000485013 NACADO15069 1562 aa46.78■■■■■ 5.08
GAD1-212ENST00000485013 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.68■■■■■ 5.06
GAD1-212ENST00000485013 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.37■■■■■ 5.01
GAD1-212ENST00000485013 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
GAD1-212ENST00000485013 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.98■■■■■ 4.95
GAD1-212ENST00000485013 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.83■■■■■ 4.93
GAD1-212ENST00000485013 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.82■■■■■ 4.93
GAD1-212ENST00000485013 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.62■■■■■ 4.89
GAD1-212ENST00000485013 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.59■■■■■ 4.89
GAD1-212ENST00000485013 SCRIBQ14160 1630 aa45.21■■■■■ 4.83
GAD1-212ENST00000485013 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.02■■■■■ 4.8
GAD1-212ENST00000485013 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
GAD1-212ENST00000485013 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.35■■■■■ 4.69
GAD1-212ENST00000485013 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.15■■■■■ 4.66
GAD1-212ENST00000485013 NCAPD3P42695 1498 aa43.24■■■■■ 4.51
GAD1-212ENST00000485013 SMARCA4P51532 1647 aa43.22■■■■■ 4.51
GAD1-212ENST00000485013 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.17■■■■■ 4.5
GAD1-212ENST00000485013 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
GAD1-212ENST00000485013 SMARCA2P51531 1590 aa43.03■■■■■ 4.48
GAD1-212ENST00000485013 HMGXB3Q12766 1538 aa42.91■■■■■ 4.46
GAD1-212ENST00000485013 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.86■■■■■ 4.45
GAD1-212ENST00000485013 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.83■■■■■ 4.45
GAD1-212ENST00000485013 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
GAD1-212ENST00000485013 WIZO95785 1651 aa42.33■■■■■ 4.37
GAD1-212ENST00000485013 NESP48681 1621 aa42.33■■■■■ 4.37
GAD1-212ENST00000485013 ERCC6Q03468 1493 aa42.3■■■■■ 4.36
GAD1-212ENST00000485013 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
GAD1-212ENST00000485013 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.1■■■■■ 4.33
GAD1-212ENST00000485013 CUX2O14529 1486 aa42.05■■■■■ 4.32
GAD1-212ENST00000485013 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.94■■■■■ 4.3
GAD1-212ENST00000485013 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.86■■■■■ 4.29
GAD1-212ENST00000485013 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
GAD1-212ENST00000485013 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
GAD1-212ENST00000485013 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.72■■■■■ 4.27
GAD1-212ENST00000485013 CFTRP13569 1480 aa41.59■■■■■ 4.25
GAD1-212ENST00000485013 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.46■■■■■ 4.23
GAD1-212ENST00000485013 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.45■■■■■ 4.23
GAD1-212ENST00000485013 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.43■■■■■ 4.22
GAD1-212ENST00000485013 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.41■■■■■ 4.22
GAD1-212ENST00000485013 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.41■■■■■ 4.22
GAD1-212ENST00000485013 WDR62O43379 1518 aa41.34■■■■■ 4.21
GAD1-212ENST00000485013 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
GAD1-212ENST00000485013 PRDM2Q13029 1718 aa41.06■■■■■ 4.16
GAD1-212ENST00000485013 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
GAD1-212ENST00000485013 TOPBP1Q92547 1522 aa40.72■■■■■ 4.11
GAD1-212ENST00000485013 ABCC8Q09428 1581 aa40.66■■■■■ 4.1
GAD1-212ENST00000485013 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.58■■■■■ 4.09
GAD1-212ENST00000485013 IFT140Q96RY7 1462 aa40.58■■■■■ 4.09
GAD1-212ENST00000485013 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
GAD1-212ENST00000485013 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
GAD1-212ENST00000485013 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
GAD1-212ENST00000485013 OSCARQ8IYS5 282 aa40.27■■■■■ 4.04
GAD1-212ENST00000485013 CUX1P39880 1505 aa40.22■■■■■ 4.03
GAD1-212ENST00000485013 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
GAD1-212ENST00000485013 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.02
GAD1-212ENST00000485013 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.19■■■■■ 4.02
GAD1-212ENST00000485013 SOGA1O94964 1423 aa40.18■■■■■ 4.02
GAD1-212ENST00000485013 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.16■■■■■ 4.02
GAD1-212ENST00000485013 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
GAD1-212ENST00000485013 WDR97A6NE52 1622 aa39.9■■■■□ 3.98
GAD1-212ENST00000485013 TRIM41Q8WV44 630 aa39.8■■■■□ 3.96
GAD1-212ENST00000485013 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.78■■■■□ 3.96
GAD1-212ENST00000485013 FBLN2P98095 1184 aa39.77■■■■□ 3.96
GAD1-212ENST00000485013 CHD1O14646 1710 aa39.77■■■■□ 3.96
GAD1-212ENST00000485013 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.75■■■■□ 3.95
GAD1-212ENST00000485013 GRIN2BQ13224 1484 aa39.75■■■■□ 3.95
GAD1-212ENST00000485013 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.75■■■■□ 3.95
GAD1-212ENST00000485013 TOP2BQ02880 1626 aa39.71■■■■□ 3.95
GAD1-212ENST00000485013 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.69■■■■□ 3.94
GAD1-212ENST00000485013 SYNJ1O43426 1573 aa39.69■■■■□ 3.94
GAD1-212ENST00000485013 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.68■■■■□ 3.94
GAD1-212ENST00000485013 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
GAD1-212ENST00000485013 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
GAD1-212ENST00000485013 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
GAD1-212ENST00000485013 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
GAD1-212ENST00000485013 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.61■■■■□ 3.93
GAD1-212ENST00000485013 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
GAD1-212ENST00000485013 ARHGEF11O15085 1522 aa39.58■■■■□ 3.93
GAD1-212ENST00000485013 SYNJ2O15056 1496 aa39.55■■■■□ 3.92
GAD1-212ENST00000485013 PBRM1Q86U86 1689 aa39.54■■■■□ 3.92
GAD1-212ENST00000485013 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.4■■■■□ 3.9
GAD1-212ENST00000485013 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.3■■■■□ 3.88
GAD1-212ENST00000485013 ADAMTS12P58397 1594 aa39.25■■■■□ 3.87
GAD1-212ENST00000485013 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.24■■■■□ 3.87
GAD1-212ENST00000485013 ARAP1Q96P48 1450 aa39.24■■■■□ 3.87
GAD1-212ENST00000485013 GRIN2AQ12879 1464 aa39.24■■■■□ 3.87
GAD1-212ENST00000485013 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.22■■■■□ 3.87
GAD1-212ENST00000485013 NUP160Q12769 1436 aa39.11■■■■□ 3.85
GAD1-212ENST00000485013 CEP170Q5SW79 1584 aa39.06■■■■□ 3.84
GAD1-212ENST00000485013 KIF27Q86VH2 1401 aa38.98■■■■□ 3.83
GAD1-212ENST00000485013 IGF1RP08069 1367 aa38.95■■■■□ 3.83
GAD1-212ENST00000485013 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.84■■■■□ 3.81
GAD1-212ENST00000485013 SHROOM2Q13796 1616 aa38.82■■■■□ 3.81
GAD1-212ENST00000485013 JPH4Q96JJ6 628 aa38.74■■■■□ 3.79
GAD1-212ENST00000485013 CUL7Q14999 1698 aa38.74■■■■□ 3.79
GAD1-212ENST00000485013 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms