RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607009.1

DUSP13-213, Transcript of dual specificity phosphatase 13, human

TSL 4

Gene DUSP13, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Exosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUSP13-213	ENST00000607009	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	THRA	P10827	490 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	PSMA2	P25787	234 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	VIPR1	P32241	457 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ADCY8	P40145	1251 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	AP1S1	P61966	158 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009		Q6ZVL8	140 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	EPN3	Q9H201	632 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	EML2	O95834	649 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	SFTPC	P11686	197 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TCF4	P15884	667 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	MIP	P30301	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	POLE2	P56282	527 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	MAX	P61244	160 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	IHH	Q14623	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	BMPER	Q8N8U9	685 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	SEPT3	Q9UH03	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	DUX1	O43812	170 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	LRCH4	O75427	683 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	CP	P00450	1065 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	IVL	P07476	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	IL1R2	P27930	398 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ACTR1B	P42025	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	GPR3	P46089	330 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ACTR1A	P61163	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	BORA	Q6PGQ7	559 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	DOK6	Q6PKX4	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	AGAP2	Q99490	1192 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	MGME1	Q9BQP7	344 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	CDH19	Q9H159	772 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DUSP13-213	ENST00000607009	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	NKX2-8	O15522	239 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	DAPK3	O43293	454 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	RAD1	O60671	282 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	MAFK	O60675	156 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	SOCS5	O75159	536 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	PDHA1	P08559	390 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	CTPS1	P17812	591 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	AMPD1	P23109	780 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	HCAR3	P49019	387 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	ATP1A2	P50993	1020 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DUSP13-213	ENST00000607009	UBXN1	Q04323	297 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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