RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM248Q9NWD8 314 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 REV3LO60673 3130 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 DFFAO00273 331 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ADH1AP07327 375 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 RHOQP17081 205 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TPSB2P20231 275 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TPSAB1Q15661 275 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TMC8Q8IU68 726 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PDIK1LQ8N165 341 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CNTD1Q8N815 330 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MCUQ8NE86 351 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOC4Q96A65 974 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 NACA2Q9H009 215 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 IRS1P35568 1242 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SLCO1A2P46721 670 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP3CCP48454 512 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF33AQ06730 810 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 LONRF1Q17RB8 773 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PARP6Q2NL67 630 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 BBS9Q3SYG4 887 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX44Q53QW1 395 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PID1Q7Z2X4 250 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPHQ9H3R5 247 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 OLFM2O95897 454 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 C8AP07357 584 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD2P08910 425 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TACR2P21452 398 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNCP24863 283 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 C5orf22Q49AR2 442 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC31Q6UY01 552 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 DENND1CQ8IV53 801 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 AGAP3Q96P47 875 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 HTATIP2Q9BUP3 242 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TLR9Q9NR96 1032 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM23A6NLE4 172 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GRM6O15303 877 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSL4O60488 711 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PEX11BO96011 259 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SSTR1P30872 391 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 FDFT1P37268 417 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ELK3P41970 407 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CLCN4P51793 760 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 COG7P83436 770 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNDC8Q6A555 127 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ITIH5Q86UX2 942 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CHSY1Q86X52 802 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TEKT5Q96M29 485 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC25Q96NG3 672 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TLDC2A0PJX2 215 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 MTSS1O43312 755 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GREM1O60565 184 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 TCEA3O75764 348 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 JCHAINP01591 159 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 GCAP28676 217 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PLD4Q96BZ4 506 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PGM2Q96G03 612 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGEF1-201ENST00000284957 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms