RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557695.1

HECTD1-218, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 3

Gene HECTD1, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD1-218	ENST00000557695	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	NCK2	O43639	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SOCS5	O75159	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	HOXC6	P09630	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	EGR1	P18146	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	TNFSF4	P23510	183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	HOXD12	P35452	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SHB	Q15464	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	CNGA3	Q16281	694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	NDST3	O95803	873 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	MYL3	P08590	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	NDUFS1	P28331	727 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	ART1	P52961	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	MDM4	O15151	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	DHH	O43323	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	PRC1	O43663	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	IDE	P14735	1019 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	TBX4	P57082	545 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	BECN2	A8MW95	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	MYL1	P05976	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	YY1	P25490	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	AK2	P54819	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD1-218	ENST00000557695	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms