RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SMAP	O00193	183 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PHB	P35232	272 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FSTL1	Q12841	308 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	HIF1A	Q16665	826 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL29	Q96CT2	875 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	KRT3	P12035	628 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PSMA2	P25787	234 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FITM2	Q8N6M3	262 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FZD9	O00144	591 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	B4GALT4	O60513	344 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	IFNB1	P01574	187 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	WEE2	P0C1S8	567 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ETS1	P14921	441 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FOXN2	P32314	431 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ASPA	P45381	313 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ADCY1	Q08828	1119 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	LBX2	Q6XYB7	198 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FBF1	Q8TES7	1133 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TFAP2B	Q92481	460 aa		19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	HOXC6	P09630	235 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ARL4C	P56559	192 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	CGB2	Q6NT52	195 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	BBS12	Q6ZW61	710 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	RNF149	Q8NC42	400 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	GGT7	Q9UJ14	662 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ABLIM1	O14639	778 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5H	O75947	161 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SETDB1	Q15047	1291 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	HAUS1	Q96CS2	278 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FZD1	Q9UP38	647 aa		19.36	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	CCNB1	P14635	433 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PROZ	P22891	400 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TAZ	Q16635	292 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PDK4	Q16654	411 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	EFHC2	Q5JST6	749 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		19.35	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ACKR2	O00590	384 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SPAG7	O75391	227 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	IL18RAP	O95256	599 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	CD19	P15391	556 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH3A1	P30838	453 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TFDP1	Q14186	410 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ACAP1	Q15027	740 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ACTL9	Q8TC94	416 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	CST8	O60676	142 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	LRCH4	O75427	683 aa		19.34	■□□□□ 0.69

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