RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.18□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 PLIN1O60240 522 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 MALP21145 153 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 CTXN1P60606 82 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 ATP8B2P98198 1209 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF40A-208ENST00000472760 TLE1Q04724 770 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF40A-208ENST00000472760 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.14□□□□□ -1.43
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