RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 TLDC2A0PJX2 215 aa26.62■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 TRIM49P0CI25 452 aa26.62■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 TRIM49CP0CI26 452 aa26.62■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 GAP43P17677 238 aa26.62■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 MAP3K10Q02779 954 aa26.62■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 NFIL3Q16649 462 aa26.62■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ANKRD62A6NC57 917 aa26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 TNFAIP3P21580 790 aa26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 MYCT1Q8N699 235 aa26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ALG6Q9Y672 507 aa26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 STK24Q9Y6E0 443 aa26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.61■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 SMIM23A6NLE4 172 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 CCDC169A6NNP5 214 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 PRELPP51888 382 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 NEDD9Q14511 834 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 SLC30A10Q6XR72 485 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 PIGWQ7Z7B1 504 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 MKNK1Q9BUB5 465 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 SEMA4AQ9H3S1 761 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 APEX2Q9UBZ4 518 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 FAM13AO94988 1023 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 FOSP01100 380 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 KRT13P13646 458 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 CIITAP33076 1130 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 RPL21P46778 160 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 MARCKSL1P49006 195 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ARHGAP44Q17R89 818 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 CCDC50Q8IVM0 306 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 PRELID2Q8N945 189 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 MAGEC3Q8TD91 643 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 KRT35Q92764 455 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 FIZ1Q96SL8 496 aa26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ASAP2O43150 1006 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 MGRN1O60291 552 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 PHF2O75151 1096 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ASNSP08243 561 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 MICALL2Q8IY33 904 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 LRRC34Q8IZ02 419 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 TEPSINQ96N21 525 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 SCLT1Q96NL6 688 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ZBTB39O15060 712 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 CFBP00751 764 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 KIF22Q14807 665 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 TTC27Q6P3X3 843 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 CEP57Q86XR8 500 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa26.59■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 CYP2J2P51589 502 aa26.58■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 SLC20A1Q8WUM9 679 aa26.58■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.58■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.58■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 DMAC2Q9NW81 257 aa26.58■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 RASAL2Q9UJF2 1139 aa26.58■■□□□ 1.85
LMO2-201ENST00000257818 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 LRRN2O75325 713 aa26.58■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 TRPC6Q9Y210 931 aa26.58■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 HADHBP55084 474 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 SLC12A4Q9UP95 1085 aa26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa26.57■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 PIK3CDO00329 1044 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 CTNNA2P26232 953 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 CHRNA3P32297 505 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 MYL7Q01449 175 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 ITIH4Q14624 930 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 CLUL1Q15846 466 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 GIMAP7Q8NHV1 300 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 AGPAT1Q99943 283 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 PARVGQ9HBI0 331 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 PCYOX1Q9UHG3 505 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.56■■□□□ 1.84
LMO2-201ENST00000257818 AGTP01019 485 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms