RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545450.6

MSLN-202, Transcript of mesothelin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSLN, Length 2,162 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLN-202ENST00000545450 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.55■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 CABS1Q96KC9 395 aa20.55■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 PNMA5Q96PV4 448 aa20.55■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 KRT12Q99456 494 aa20.55■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 POTEMA6NI47 508 aa20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 NOL4O94818 638 aa20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 ARHGAP4P98171 946 aa20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 EHHADHQ08426 723 aa20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 MTMR2Q13614 643 aa20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 LPAR1Q92633 364 aa20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.54■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 PIK3CDO00329 1044 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 FTCDO95954 541 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 NLRP14Q86W24 1093 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 TBC1D5Q92609 795 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 MYO1FO00160 1098 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 CYP3A7P24462 503 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 KLRC1P26715 233 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 DYMQ7RTS9 669 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 HOOK2Q96ED9 719 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 MBOAT7Q96N66 472 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 POLD4Q9HCU8 107 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.53■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 SREBF1P36956 1147 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 PSMD2Q13200 908 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 TSG101Q99816 390 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 H0YHG0 523 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 FAM107AO95990 144 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 PTPRAP18433 802 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 TRAF1Q13077 416 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 SPP2Q13103 211 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 TRADDQ15628 312 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 SLC18A3Q16572 532 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 LDHDQ86WU2 507 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 USP38Q8NB14 1042 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 UIMC1Q96RL1 719 aa20.52■□□□□ 0.88
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MSLN-202ENST00000545450 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.52■□□□□ 0.88
MSLN-202ENST00000545450 ZNF536O15090 1300 aa20.52■□□□□ 0.87
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MSLN-202ENST00000545450 RAD51CO43502 376 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 CFBP00751 764 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 VCAM1P19320 739 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 SEC24CP53992 1094 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 TNNC1P63316 161 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 PDIA5Q14554 519 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 KLRG1Q96E93 195 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 PLAAQ9Y263 795 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 ERCC3P19447 782 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 DLK2Q6UY11 383 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 RAD54LQ92698 747 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.51■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 WDR18Q9BV38 432 aa20.51■□□□□ 0.87
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MSLN-202ENST00000545450 RLFQ13129 1914 aa20.5■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 DNA2P51530 1060 aa20.5■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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MSLN-202ENST00000545450 RAB34Q9BZG1 259 aa20.5■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.5■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.49■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 FAM86B1E9PN63 330 aa20.49■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.49■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 PLCB4Q15147 1175 aa20.49■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 LRRC41Q15345 812 aa20.49■□□□□ 0.87
MSLN-202ENST00000545450 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.49■□□□□ 0.87
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