RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	RTN1	Q16799	776 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	GPRASP2	Q96D09	838 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	USP26	Q9BXU7	913 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	PIEZO1	Q92508	2521 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	IKBKE	Q14164	716 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2S	Q16763	222 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TCTN1	Q2MV58	587 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	NLRX1	Q86UT6	975 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01553	A4QN01	128 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNA2	P16389	499 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	ITGB5	P18084	799 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	SERINC5	Q86VE9	423 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	CD320	Q9NPF0	282 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		20.34	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	KAT6A	Q92794	2004 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP9A	O75110	1047 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC27	P30260	824 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXL16	Q8N461	479 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	CDHR1	Q96JP9	859 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	CPA1	P15085	419 aa		20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	NID2	Q14112	1375 aa		20.32	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	STXBP3	O00186	592 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	MAFG	O15525	162 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	NAPA	P54920	295 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAM17	P78536	824 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	MBTPS1	Q14703	1052 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM50	Q86XT4	487 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	JADE2	Q9NQC1	790 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	BARHL2	Q9NY43	387 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	INSL6	Q9Y581	213 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	TREH	O43280	583 aa		20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	LGR5	O75473	907 aa		20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	MTMR1	Q13613	665 aa		20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZUG5	572 aa		20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	SI	P14410	1827 aa		20.3	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	REC8	O95072	547 aa		20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	APOBR	Q0VD83	1088 aa		20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	20.29	■□□□□ 0.84	4e-8	■■■■□ 26.4
MRPL28-203	ENST00000429738	GJD3	Q8N144	294 aa		20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	BRF1	Q92994	677 aa		20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		20.29	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	EMSY	Q7Z589	1322 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	CAND2	O75155	1236 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNA5	P22460	613 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS6KB1	P23443	525 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	ADCY7	P51828	1080 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	SP4	Q02446	784 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MRPL28-203	ENST00000429738	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	20.28	■□□□□ 0.84

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