RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-205ENST00000589649 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TOMM40-205ENST00000589649 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa28.33■■■□□ 2.13
TOMM40-205ENST00000589649 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TOMM40-205ENST00000589649 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.33■■■□□ 2.13
TOMM40-205ENST00000589649 SCN5AQ14524 2016 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 CDC45O75419 566 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 CALM1P0DP23 149 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 CALM2P0DP24 149 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 CALM3P0DP25 149 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 MICU3Q86XE3 530 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 C7orf31Q8N865 590 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 FANCBQ8NB91 859 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 NEK1Q96PY6 1258 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.32■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 CDH23Q9H251 3354 aa28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 HAS3O00219 553 aa28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 DLL1O00548 723 aa28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 PITPNM1O00562 1244 aa28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 F2P00734 622 aa28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 SEMA3FQ13275 785 aa28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 BFSP2Q13515 415 aa28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 RNF20Q5VTR2 975 aa28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 MSRAQ9UJ68 235 aa28.31■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 PPFIA4O75335 1185 aa28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 TGFB3P10600 412 aa28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 MYOGP15173 224 aa28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 HIC1Q14526 733 aa28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 TMTC3Q6ZXV5 915 aa28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 CUL5Q93034 780 aa28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.3■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 PFKMP08237 780 aa28.29■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 RAB30Q15771 203 aa28.29■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 SGMS1Q86VZ5 419 aa28.29■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.29■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.29■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.28■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 PIK3CDO00329 1044 aa28.28■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 RFC2P35250 354 aa28.28■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 GPNMBQ14956 572 aa28.28■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 WNT8BQ93098 351 aa28.28■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.28■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.28■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.28■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 ICAM3P32942 547 aa28.27■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 UBE2SQ16763 222 aa28.27■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 GNPTABQ3T906 1256 aa28.27■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 APOA5Q6Q788 366 aa28.27■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.27■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.27■■■□□ 2.12
TOMM40-205ENST00000589649 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.26■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.26■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.26■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 CAGE1Q8TC20 777 aa28.26■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.26■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 FIBPO43427 364 aa28.25■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 STAM2O75886 525 aa28.25■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 ACTN1P12814 892 aa28.25■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 CPA1P15085 419 aa28.25■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 SELPP16109 830 aa28.25■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.25■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.25■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.25■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 LGALS2P05162 132 aa28.24■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 CKBP12277 381 aa28.24■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 SP4Q02446 784 aa28.24■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 SLC28A3Q9HAS3 691 aa28.24■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 EYSQ5T1H1 3165 aa28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 PTK7Q13308 1070 aa28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 NEDD9Q14511 834 aa28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 METTL7BQ6UX53 244 aa28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 USP38Q8NB14 1042 aa28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 GPR20Q99678 358 aa28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 GBF1Q92538 1859 aa28.23■■■□□ 2.11
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TOMM40-205ENST00000589649 H3BRB1 525 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 RBL2Q08999 1139 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 RTN1Q16799 776 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 TCTN1Q2MV58 587 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 TRIM50Q86XT4 487 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-205ENST00000589649 A0A0C4DFX4 3053 aa28.22■■■□□ 2.11
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