RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329734.3

IRX3-201, Transcript of iroquois homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRX3, Length 2,601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3-201ENST00000329734 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 MAGEA8P43361 318 aa22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 CASP1P29466 404 aa22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 FANCCQ00597 558 aa22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 UIMC1Q96RL1 719 aa22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.97■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 TMEM232C9JQI7 657 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 RWDD2BP57060 319 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 TPM4P67936 248 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 LETM2Q2VYF4 491 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 SH3GL3Q99963 347 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 CCP110O43303 1012 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 PAX3P23760 479 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 DGKZQ13574 1117 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 CNNM3Q8NE01 707 aa22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 FZD9O00144 591 aa22.95■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 PLA2G4AP47712 749 aa22.95■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.95■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 STAMQ92783 540 aa22.95■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 C6orf50Q9HD87 102 aa22.95■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.95■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.95■■□□□ 1.27
IRX3-201ENST00000329734 SERPINC1P01008 464 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 DHX58Q96C10 678 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 PP2D1A8MPX8 630 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 GRIK3Q13003 919 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 CARD6Q9BX69 1037 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 HACL1Q9UJ83 578 aa22.95■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 SMARCA1P28370 1054 aa22.94■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 TBCKQ8TEA7 893 aa22.94■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.94■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.94■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 ZBTB5O15062 677 aa22.94■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USH1GQ495M9 461 aa22.94■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 DLK2Q6UY11 383 aa22.94■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 UBXN4Q92575 508 aa22.94■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 UBASH3AP57075 661 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 NLRP12P59046 1061 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 SPON1Q9HCB6 807 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L15C9J2P7 530 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L11C9JVI0 530 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L18D6R9N7 530 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L22D6RA61 530 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L19D6RCP7 530 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L20D6RJB6 530 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L24Q0WX57 530 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 TEPSINQ96N21 525 aa22.93■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 GNA11P29992 359 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 ADCY7P51828 1080 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 CORO7P57737 925 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 PLIN2Q99541 437 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 GOPCQ9HD26 462 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 EDIL3O43854 480 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 AFMP43652 599 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 FAM83AQ86UY5 434 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 RPS6KA3P51812 740 aa22.91■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 MNAT1P51948 309 aa22.91■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.91■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 DCAF4Q8WV16 495 aa22.91■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 GJA10Q969M2 543 aa22.91■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.91■■□□□ 1.26
IRX3-201ENST00000329734 RMI1Q9H9A7 625 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms