RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261590.12

DSG2-201, Transcript of desmoglein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DSG2, Length 5,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2-201ENST00000261590 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.14■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.14■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 SLMAPQ14BN4 828 aa24.14■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 DLGAP5Q15398 846 aa24.14■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 54.9
DSG2-201ENST00000261590 FAM149B1Q96BN6 582 aa24.14■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 HOXC9P31274 260 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 ODR4Q5SWX8 454 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 GALNT17Q6IS24 598 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 RASGRF2O14827 1237 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 MCF2P10911 925 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 MTMR6Q9Y217 621 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 SPAG7O75391 227 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 STK17AQ9UEE5 414 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PNMA2Q9UL42 364 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 CLIC4Q9Y696 253 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.13■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PDE6BP35913 854 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 APOL6Q9BWW8 343 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 ZFYVE9O95405 1425 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 CYP4A11Q02928 519 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 FLOT2Q14254 428 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 HIPK4Q8NE63 616 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 MID2Q9UJV3 735 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 ATP5JP18859 108 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 NR1D1P20393 614 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PTGDRQ13258 359 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 FBXO11Q86XK2 927 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 CHEK2O96017 543 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 CXCR5P32302 372 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.12■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 BTBD18B2RXH4 712 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 MAPK13O15264 365 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PLS3P13797 630 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 ARL4AP40617 200 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 IGBP1P78318 339 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 KLRF2D3W0D1 207 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PYGBP11216 843 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 NR2F2P24468 414 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PNMA1Q8ND90 353 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 NEK9Q8TD19 979 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 FTCDO95954 541 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 LLGL1Q15334 1064 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 CREB3O43889 395 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.11■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 USP19O94966 1318 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 H0YIN7 160 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 ARHGEF9O43307 516 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 TCIRG1Q13488 830 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 MOCS3O95396 460 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 POLA2Q14181 598 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PBKQ96KB5 322 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 TNKSO95271 1327 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PYGLP06737 847 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 GCKRQ14397 625 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 PPP4R4Q6NUP7 873 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 EXOC4Q96A65 974 aa24.1■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 KCTD6Q8NC69 237 aa24.09■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 GPT2Q8TD30 523 aa24.09■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 NCLNQ969V3 563 aa24.09■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 DYDC2Q96IM9 177 aa24.09■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 NPATQ14207 1427 aa24.09■■□□□ 1.45
DSG2-201ENST00000261590 SYCE1LA8MT33 242 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.5 ms