RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584327.5

SNHG15-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 15, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG15, Length 505 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG15-208	ENST00000584327	TRIB2	Q92519	343 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNHG15-208	ENST00000584327	SHISA4	Q96DD7	197 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNHG15-208	ENST00000584327	TINF2	Q9BSI4	451 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNHG15-208	ENST00000584327	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNHG15-208	ENST00000584327	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNHG15-208	ENST00000584327	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SNHG15-208	ENST00000584327	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNHG15-208	ENST00000584327	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNHG15-208	ENST00000584327	LCT	P09848	1927 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SNHG15-208	ENST00000584327	HMGCR	P04035	888 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ELN	P15502	786 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	FOSB	P53539	338 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	KRT40	Q6A162	431 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	FGD4	Q96M96	766 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	IWS1	Q96ST2	819 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PXMP2	Q9NR77	195 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	MMP1	P03956	469 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	KRT2	P35908	639 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PDE4D	Q08499	809 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ARMCX2	Q7L311	632 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	MORC4	Q8TE76	937 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ANO3	Q9BYT9	981 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	TMEM260	Q9NX78	707 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ASTN1	O14525	1302 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327		H3BQV1	296 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	IGHA2	P01877	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	INHA	P05111	366 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	NR3C2	P08235	984 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PDC	P20941	246 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	EDNRB	P24530	442 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	CCND2	P30279	289 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	CYP2C19	P33261	490 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	UBXN2A	P68543	259 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	GUCY1B3	Q02153	619 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PGM5	Q15124	567 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	NPY5R	Q15761	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	STXBP2	Q15833	593 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	IFFO2	Q5TF58	517 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	RPTOR	Q8N122	1335 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327		M0R2N6	131 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PGBD1	Q96JS3	809 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	VTA1	Q9NP79	307 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	BTBD18	B2RXH4	712 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	STAM2	O75886	525 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	SREBF1	P36956	1147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	TRIM32	Q13049	653 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ACVR2B	Q13705	512 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	OXER1	Q8TDS5	423 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	CYBA	P13498	195 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ARHGAP4	P98171	946 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	NR5A1	Q13285	461 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	IL31RA	Q8NI17	732 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	ARMC5	Q96C12	935 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SNHG15-208	ENST00000584327	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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