RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 HS1BP3Q53T59 392 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC174Q6PII3 467 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 TNS4Q8IZW8 715 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 AOPEPQ8N6M6 819 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 C2orf69Q8N8R5 385 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 WRNIP1Q96S55 665 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SLF1Q9BQI6 1058 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR18Q9BV38 432 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB34Q9BZG1 259 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 DISC1Q9NRI5 854 aa11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 HTTP42858 3142 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 PP2D1A8MPX8 630 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SMTNL1A8MU46 457 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 AP5Z1O43299 807 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 AFMP43652 599 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 TPM4P67936 248 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 DPYDQ12882 1025 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MTMR2Q13614 643 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MORC3Q14149 939 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 KARSQ15046 597 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 ISM2Q6H9L7 571 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 CABP7Q86V35 215 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MLKLQ8NB16 471 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA20Q8TB22 786 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MBOAT7Q96N66 472 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 CUEDC2Q9H467 287 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 DACH1Q9UI36 760 aa11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 OPLAHO14841 1288 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 IKBKBO14920 756 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPRAP18433 802 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 VCAM1P19320 739 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP3A7P24462 503 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CDC25AP30304 524 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SREBF1P36956 1147 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TECP42680 631 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TXKP42681 527 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP4P98171 946 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SARM1Q6SZW1 724 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 GSDMAQ96QA5 445 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TSKSQ9UJT2 592 aa11.7□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 MARCH6O60337 910 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ICAM1P05362 532 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 MYL1P05976 194 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 POLR2MP0CAP2 368 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 BMP6P22004 513 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF75DP51815 510 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 BACE1P56817 501 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 MYL5Q02045 173 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SPP2Q13103 211 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PDIA5Q14554 519 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CALML4Q96GE6 196 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 C12orf42Q96LP6 360 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM5Q9C035 493 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PNMA2Q9UL42 364 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 FZD1Q9UP38 647 aa11.69□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 C19orf81C9J6K1 198 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC26A4O43511 780 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CA12O43570 354 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 FLOT1O75955 427 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP3A4P08684 503 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PLCG1P19174 1290 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CIITAP33076 1130 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 NCAPHQ15003 741 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 PLA2G4DQ86XP0 818 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 HAS1Q92839 578 aa11.68□□□□□ -0.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC102AQ96A19 550 aa11.68□□□□□ -0.54
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