RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0297Q0297 ENT1Q12518 454 aa23.87■■□□□ 1.41
Q0297Q0297 YIL055CP40523 627 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
Q0297Q0297 RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
Q0297Q0297 ENV9Q08651 330 aa23.77■■□□□ 1.4
Q0297Q0297 PRP45P28004 379 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
Q0297Q0297 PSK1P31374 1356 aa23.73■■□□□ 1.39
Q0297Q0297 GLN1P32288 370 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Q0297Q0297 CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
Q0297Q0297 TY4B-HP0C2J7 1802 aa23.7■■□□□ 1.39
Q0297Q0297 TY4B-JP47024 1803 aa23.7■■□□□ 1.39
Q0297Q0297 YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Q0297Q0297 PRP5P21372 849 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
Q0297Q0297 IMH1Q06704 911 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Q0297Q0297 YRF1-2P40105 1681 aa23.63■■□□□ 1.37
Q0297Q0297 ADE6P38972 1358 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Q0297Q0297 SCT1P32784 759 aa23.6■■□□□ 1.37
Q0297Q0297 LEU2P04173 364 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
Q0297Q0297 CSE4P36012 229 aa23.52■■□□□ 1.36
Q0297Q0297 MTR4P47047 1073 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Q0297Q0297 MSB3P48566 633 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
Q0297Q0297 YMR074CQ04773 145 aa23.49■■□□□ 1.35
Q0297Q0297 RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Q0297Q0297 RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Q0297Q0297 PRP43P53131 767 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Q0297Q0297 LEU3P08638 886 aa23.4■■□□□ 1.34
Q0297Q0297 TCB1Q12466 1186 aa23.38■■□□□ 1.33
Q0297Q0297 YML133CQ03099 1374 aa23.37■■□□□ 1.33
Q0297Q0297 YLL067CQ07888 1374 aa23.37■■□□□ 1.33
Q0297Q0297 YLL066CQ99208 1374 aa23.37■■□□□ 1.33
Q0297Q0297 SLM3Q12093 417 aa23.35■■□□□ 1.33
Q0297Q0297 POL5P39985 1022 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Q0297Q0297 IES2P40154 320 aa23.32■■□□□ 1.32
Q0297Q0297 MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Q0297Q0297 FKH1P40466 484 aa23.3■■□□□ 1.32
Q0297Q0297 URB1P34241 1764 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Q0297Q0297 RSF2P46974 1380 aa23.27■■□□□ 1.31
Q0297Q0297 PRI1P10363 409 aa23.26■■□□□ 1.31
Q0297Q0297 RTG3P38165 486 aa23.26■■□□□ 1.31
Q0297Q0297 BUD31P25337 157 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
Q0297Q0297 ENP1P38333 483 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Q0297Q0297 YIL177CP40434 1758 aa23.2■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 YJL225CP40889 1758 aa23.2■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 RTF1P53064 558 aa23.2■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 PDI1P17967 522 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 GAS4Q08271 471 aa23.19■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 MHP1P43638 1398 aa23.18■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 DPS1P04802 557 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 DOT5P40553 215 aa23.18■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 XKS1P42826 600 aa23.18■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 FKS3Q04952 1785 aa23.17■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 ROM2P51862 1356 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 PDS5Q04264 1277 aa23.15■■□□□ 1.3
Q0297Q0297 RPN11P43588 306 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Q0297Q0297 YRF1-3P0CX14 1859 aa23.12■■□□□ 1.29
Q0297Q0297 YRF1-7P0CX15 1859 aa23.12■■□□□ 1.29
Q0297Q0297 UBP1P25037 809 aa23.12■■□□□ 1.29
Q0297Q0297 YRF1-6P53819 1859 aa23.12■■□□□ 1.29
Q0297Q0297 APC1P53886 1748 aa23.08■■□□□ 1.29
Q0297Q0297 YKL133CP36066 463 aa23.08■■□□□ 1.29
Q0297Q0297 FOX2Q02207 900 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Q0297Q0297 YEF3P16521 1044 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Q0297Q0297 YJL181WP46987 611 aa23.03■■□□□ 1.28
Q0297Q0297 TAP42Q04372 366 aa23.02■■□□□ 1.28
Q0297Q0297 GRX4P32642 244 aa23.01■■□□□ 1.27
Q0297Q0297 HIM1Q06674 414 aa22.99■■□□□ 1.27
Q0297Q0297 LAM6Q08001 693 aa22.98■■□□□ 1.27
Q0297Q0297 AUS1Q08409 1394 aa22.98■■□□□ 1.27
Q0297Q0297 COBP00163 385 aa22.96■■□□□ 1.27
Q0297Q0297 EDE1P34216 1381 aa22.94■■□□□ 1.26
Q0297Q0297 SEC3P33332 1336 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Q0297Q0297 PRP40P33203 583 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Q0297Q0297 YRF1-4O13559 1382 aa22.93■■□□□ 1.26
Q0297Q0297 RCR1P38212 213 aa22.93■■□□□ 1.26
Q0297Q0297 NPR2P39923 615 aa22.91■■□□□ 1.26
Q0297Q0297 MEC3Q02574 474 aa22.91■■□□□ 1.26
Q0297Q0297 KAR2P16474 682 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Q0297Q0297 SIR4P11978 1358 aa22.88■■□□□ 1.25
Q0297Q0297 FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
Q0297Q0297 YKR075CP36155 307 aa22.85■■□□□ 1.25
Q0297Q0297 LYS4P49367 693 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
Q0297Q0297 SNF2P22082 1703 aa22.83■■□□□ 1.25
Q0297Q0297 YBL086CP38177 466 aa22.83■■□□□ 1.25
Q0297Q0297 ADE16P54113 591 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Q0297Q0297 BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data22.78■■□□□ 1.24not detected
Q0297Q0297 NST1P53935 1240 aa22.78■■□□□ 1.24
Q0297Q0297 PAP2P53632 584 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Q0297Q0297 RPO41P13433 1351 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Q0297Q0297 UGA2P38067 497 aa22.75■■□□□ 1.23
Q0297Q0297 ALD2P47771 506 aa22.74■■□□□ 1.23
Q0297Q0297 ATG13Q06628 738 aa22.74■■□□□ 1.23
Q0297Q0297 GTT3P39996 337 aa22.73■■□□□ 1.23
Q0297Q0297 TRK1P12685 1235 aa22.72■■□□□ 1.23
Q0297Q0297 PSD2P53037 1138 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Q0297Q0297 SSA2P10592 639 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Q0297Q0297 INP54Q08227 384 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Q0297Q0297 DSD1P53095 428 aa22.65■■□□□ 1.22
Q0297Q0297 HSP104P31539 908 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Q0297Q0297 CTH1P47976 325 aa22.63■■□□□ 1.21
Q0297Q0297 OSM1P21375 501 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Q0297Q0297 RIM15P43565 1770 aa22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.3 ms