RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	BLID	Q8IZY5	108 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	SHISA4	Q96DD7	197 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	PORCN	Q9H237	461 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		19.28	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	NFIB	O00712	420 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	MEIS2	O14770	477 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	KRT2	P35908	639 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	SP3	Q02447	781 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	KCTD2	Q14681	263 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	EFCC1	Q9HA90	598 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TBCD-223	ENST00000576691	GPR25	O00155	361 aa		19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	SLC34A2	O95436	690 aa		19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	CFB	P00751	764 aa		19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	DDIT3	P35638	169 aa		19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	KIF22	Q14807	665 aa		19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	NPY5R	Q15761	445 aa		19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	MMP19	Q99542	508 aa		19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		19.26	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691		M0R2N6	131 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	PTPRE	P23469	700 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	NUCB2	P80303	420 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	GUCY1B3	Q02153	619 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	AP3B2	Q13367	1082 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	ARHGEF6	Q15052	776 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	WDR78	Q5VTH9	848 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	NSMF	Q6X4W1	530 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	GPR142	Q7Z601	462 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	MTMR6	Q9Y217	621 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	BTBD18	B2RXH4	712 aa		19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	FOSB	P53539	338 aa		19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	FCGRT	P55899	365 aa		19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	TBC1D5	Q92609	795 aa		19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		19.24	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	FKTN	O75072	461 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	GNRH1	P01148	92 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	GRB14	Q14449	540 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	DNER	Q8NFT8	737 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		19.23	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691		B4DLN1	442 aa		19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	POTEB2	H3BUK9	544 aa		19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	PSMC4	P43686	418 aa		19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	MCTP1	Q6DN14	999 aa		19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	BRAP	Q7Z569	592 aa		19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	TNFRSF25	Q93038	417 aa		19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	ERO1A	Q96HE7	468 aa		19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	19.22	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	BRD1	O95696	1058 aa		19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	HOXD10	P28358	340 aa		19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	UBE2S	Q16763	222 aa		19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	MORN1	Q5T089	497 aa		19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	OXER1	Q8TDS5	423 aa		19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		19.21	■□□□□ 0.67
TBCD-223	ENST00000576691	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	19.2	■□□□□ 0.66
TBCD-223	ENST00000576691	ADORA2A	P29274	412 aa		19.2	■□□□□ 0.66
TBCD-223	ENST00000576691	NR5A1	Q13285	461 aa		19.2	■□□□□ 0.66
TBCD-223	ENST00000576691	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	19.2	■□□□□ 0.66

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