RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 NSMFQ6X4W1 530 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 TICAM2Q86XR7 235 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 TMEM47Q9BQJ4 181 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 CYP39A1Q9NYL5 469 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 TBX21Q9UL17 535 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 ASTN1O14525 1302 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 MROH7Q68CQ1 1323 aa19.97■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 ARVCFO00192 962 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 TIMP1P01033 207 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 ICAM1P05362 532 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 TOP1P11387 765 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 BEX3Q00994 111 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 BTNL9Q6UXG8 535 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 RILPL2Q969X0 211 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 SEMA6BQ9H3T3 888 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-211ENST00000513325 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 NKX3-2P78367 333 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 SYDE2Q5VT97 1194 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 SMC5Q8IY18 1101 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 GPCPD1Q9NPB8 672 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 PDGFCQ9NRA1 345 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 ZMYM6O95789 1325 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 CCDC171Q6TFL3 1326 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 SMPD1P17405 629 aa19.94■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 PTGS1P23219 599 aa19.94■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 MFSD6Q6ZSS7 791 aa19.94■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.94■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 SDSP20132 328 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 AAMPQ13685 434 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 AKNAD1Q5T1N1 836 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 MFSD5Q6N075 450 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 TAPT1Q6NXT6 567 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 CXCL17Q6UXB2 119 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 TLK2Q86UE8 772 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 FAM126BQ8IXS8 530 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 AP5M1Q9H0R1 490 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
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HERC3-211ENST00000513325 PDHBP11177 359 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 TMEM63BQ5T3F8 832 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 IQSEC1Q6DN90 963 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 CHD1LQ86WJ1 897 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D10CQ8IV04 446 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 TTC14Q96N46 770 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 TLR3O15455 904 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 IGHDP01880 384 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 PCP11498 1178 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 MORC4Q8TE76 937 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 VTA1Q9NP79 307 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 LRRC37A2A6NM11 1700 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 CABYRO75952 493 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 ZNF543Q08ER8 600 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 C16orf59Q7L2K0 433 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 SLC43A3Q8NBI5 491 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 MYLIPQ8WY64 445 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 Q9Y3F1 56 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 LCTP09848 1927 aa19.9■□□□□ 0.78
HERC3-211ENST00000513325 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 CD4P01730 458 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 SNHG28P0DPA3 235 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 CSF2RAP15509 400 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 NEDD4P46934 1319 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 NUCB1Q02818 461 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 ITGA7Q13683 1181 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 TMEM199Q8N511 208 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 CLEC4DQ8WXI8 215 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 OSBPL3Q9H4L5 887 aa19.89■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 GRIN2DO15399 1336 aa19.88■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 ZNF213O14771 459 aa19.88■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 ZEB2O60315 1214 aa19.88■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 ACRP10323 421 aa19.88■□□□□ 0.77
HERC3-211ENST00000513325 CALML3P27482 149 aa19.88■□□□□ 0.77
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