RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 WDR24Q96S15 920 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPNS1-201ENST00000311008 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 KIFC2Q96AC6 838 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 CARD6Q9BX69 1037 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 SNED1Q8TER0 1413 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 GAKO14976 1311 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 FLT1P17948 1338 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 RHOBTB3O94955 611 aa22.03■■□□□ 1.12
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SPNS1-201ENST00000311008 NOVP48745 357 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 DMTNQ08495 405 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 TUBB2AQ13885 445 aa22.03■■□□□ 1.12
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SPNS1-201ENST00000311008 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.03■■□□□ 1.12
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SPNS1-201ENST00000311008 DESI2Q9BSY9 194 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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SPNS1-201ENST00000311008 PPP1R2P41236 205 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-201ENST00000311008 PSMA7O14818 248 aa22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 OR52Z1P0C646 297 aa22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 THAP9Q9H5L6 903 aa22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 GDAQ9Y2T3 454 aa22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 ESYT2A0FGR8 921 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 RHBDL3P58872 404 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 MTF1Q14872 753 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 FAM182BQ5T319 152 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 TMC4Q7Z404 712 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 VPS16Q9H269 839 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 SMCO2A6NFE2 343 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 SERPINB2P05120 415 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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SPNS1-201ENST00000311008 NEK8Q86SG6 692 aa22■■□□□ 1.11
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SPNS1-201ENST00000311008 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 TAB2Q9NYJ8 693 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 MTMR7Q9Y216 660 aa22■■□□□ 1.11
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SPNS1-201ENST00000311008 PPP2R3AQ06190 1150 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 CABP7Q86V35 215 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PQC6 194 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 KLRC4O43908 158 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 CLCN6P51797 869 aa21.99■■□□□ 1.11
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SPNS1-201ENST00000311008 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.99■■□□□ 1.11
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SPNS1-201ENST00000311008 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.98■■□□□ 1.11
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SPNS1-201ENST00000311008 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 LZTFL1Q9NQ48 299 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 COBLO75128 1261 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-201ENST00000311008 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.96■■□□□ 1.11
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