RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 TSPY8P0CW00 308 aa24.95■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 FCGRTP55899 365 aa24.95■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.95■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF213O14771 459 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 HERVK_113P62684 666 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 APOBRQ0VD83 1088 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 MCM5P33992 734 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 NCOA7Q8NI08 942 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM47Q96LD4 638 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 TOMM22Q9NS69 142 aa24.94■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 TFAP4Q01664 338 aa24.93■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.93■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.93■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 LPAR1Q92633 364 aa24.93■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.92■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 VCPKMTQ9H867 229 aa24.92■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 INCENPQ9NQS7 918 aa24.92■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.92■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.92■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 DTNBO60941 627 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 CTDNEP1O95476 244 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 CTGFP29279 349 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 RESTQ13127 1097 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 TSPY26PQ9H489 355 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 GOPCQ9HD26 462 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 MGAMO43451 1857 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 TSPY2A6NKD2 308 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 PRMT2P55345 433 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 HAND2P61296 217 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 NYAP2Q9P242 653 aa24.91■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 COG2Q14746 738 aa24.9■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 FERMT3Q86UX7 667 aa24.9■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.9■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.9■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 SRRDQ9UH36 339 aa24.9■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 PRC1O43663 620 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 RAET1EQ8TD07 263 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 COA7Q96BR5 231 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 CEP95Q96GE4 821 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.89■■□□□ 1.58
SGMS1-210ENST00000619438 H3BQV1 296 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 RGS22Q8NE09 1264 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 PEX10O60683 326 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 TTLL1O95922 423 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF11Q86T75 865 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF3Q9H094 633 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 MYPNQ86TC9 1320 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 FLOT1O75955 427 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 SOX10P56693 466 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 ANTXR2P58335 489 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.87■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 BRCA2P51587 3418 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 ERVK-9P63128 1117 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 ERVK-24P63145 666 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 TRDNQ13061 729 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 ATL3Q6DD88 541 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 CHST3Q7LGC8 479 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 DDX11Q96FC9 970 aa24.86■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 F5H6K3 240 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 ORC4O43929 436 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 PRKCZQ05513 592 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 KLRC3Q07444 240 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 Q3C1V9 767 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SGMS1-210ENST00000619438 STX8Q9UNK0 236 aa24.85■■□□□ 1.57
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