RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 CRKP46108 304 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 GABPAQ06546 454 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PICALMQ13492 652 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SLC39A14Q15043 492 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CAMK4Q16566 473 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 AOC3Q16853 763 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 DACT2Q5SW24 774 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 FSIP1Q8NA03 581 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PNMA1Q8ND90 353 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 FAM210AQ96ND0 272 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MRIQ9BWK5 157 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 USP40Q9NVE5 1235 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CTAGE5O15320 804 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KINO60870 393 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PPP6R2O75170 966 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ATP2B1P20020 1258 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 GNAQP50148 359 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 GRM4Q14833 912 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PTPAQ15257 358 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 UVSSAQ2YD98 709 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 TTLL6Q8N841 843 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 JMYQ8N9B5 988 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 RNF217Q8TC41 542 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ZBTB9Q96C00 473 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SHISA4Q96DD7 197 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CCDC189A1A4V9 331 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KLHL33A6NCF5 533 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SNPHO15079 494 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PPIP5K2O43314 1243 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 C21orf2O43822 256 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SCG2P13521 617 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KRT2P35908 639 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 NOVP48745 357 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 TYRO3Q06418 890 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 NR5A1Q13285 461 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CCDC93Q567U6 631 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 TSC1Q92574 1164 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ITFG2Q969R8 447 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SWAP70Q9UH65 585 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 STX8Q9UNK0 236 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GVL5 298 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 HLA-DOAP06340 250 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CMA1P23946 247 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 NDUFA8P51970 172 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 GPATCH11Q8N954 259 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 OXER1Q8TDS5 423 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 CEP95Q96GE4 821 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SGSM3Q96HU1 749 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 DEF6Q9H4E7 631 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 MYH8P13535 1937 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PSME4Q14997 1843 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-204ENST00000546621 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms