RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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SHQ1-205ENST00000468371 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 NOD1Q9Y239 953 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 PRMT2P55345 433 aa6.91□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 POLA2Q14181 598 aa6.91□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 UBE3CQ15386 1083 aa6.91□□□□□ -1.3
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SHQ1-205ENST00000468371 CAP2P40123 477 aa6.91□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.91□□□□□ -1.3
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SHQ1-205ENST00000468371 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
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SHQ1-205ENST00000468371 KBTBD13C9JR72 458 aa6.88□□□□□ -1.31
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SHQ1-205ENST00000468371 CDK8P49336 464 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-205ENST00000468371 PDE1AP54750 535 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-205ENST00000468371 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-205ENST00000468371 ZIC5Q96T25 663 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-205ENST00000468371 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-205ENST00000468371 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.88□□□□□ -1.31
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