RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021990.3

Ptdss1-201, Transcript of Phosphatidylserine synthase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptdss1, Length 3,424 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm10142J3KMP7 120 aa4.63□□□□□ -1.67
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Muc16A0A140LJ72 8478 aa4.62□□□□□ -1.67
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa4.62□□□□□ -1.67
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce1fB9EJP6 147 aa4.58□□□□□ -1.68
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce1a1Q9CQH5 143 aa4.58□□□□□ -1.68
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce3cQ91V05 98 aa4.55□□□□□ -1.68
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap4-7Q9D732 168 aa4.55□□□□□ -1.68
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap19-4Q925H7 84 aa4.53□□□□□ -1.68
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap4-9B1AQA9 244 aa4.51□□□□□ -1.69
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce3eF8VQJ0 98 aa4.51□□□□□ -1.69
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce3fQ6PAI4 98 aa4.51□□□□□ -1.69
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Mt4P47945 62 aa4.5□□□□□ -1.69
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce3dE9Q8V1 98 aa4.5□□□□□ -1.69
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sprr2kO70562 68 aa4.42□□□□□ -1.7
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sprr2iO70560 76 aa4.37□□□□□ -1.71
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa4.35□□□□□ -1.71
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce3aQ497I5 98 aa4.31□□□□□ -1.72
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce1bQ9D149 137 aa4.28□□□□□ -1.72
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa4.27□□□□□ -1.73
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce1lQ9D1G7 135 aa4.25□□□□□ -1.73
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sprr2hO70559 108 aa4.25□□□□□ -1.73
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 2300003K06RikA2A4M0 262 aa4.24□□□□□ -1.73
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap4-16Q91W93 202 aa4.2□□□□□ -1.74
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sprr2fO70557 76 aa4.17□□□□□ -1.74
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lce1kJ3QP15 125 aa4.17□□□□□ -1.74
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa4.12□□□□□ -1.75
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sprr2eO70556 76 aa4.05□□□□□ -1.76
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Mt1P02802 61 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa3.89□□□□□ -1.79
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa3.85□□□□□ -1.79
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm11568A2A4M2 211 aa3.76□□□□□ -1.81
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap9-1Q64526 186 aa3.76□□□□□ -1.81
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 A0A1Y7VJH8 109 aa3.71□□□□□ -1.82
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa3.63□□□□□ -1.83
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 A0A1Y7VLE6 161 aa3.63□□□□□ -1.83
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Eppk1Q8R0W0 6548 aa3.63□□□□□ -1.83
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Muc19Q6PZE0 7524 aa3.61□□□□□ -1.83
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Mt3P28184 68 aa3.6□□□□□ -1.83
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm11559Q9D3H7 191 aa3.6□□□□□ -1.83
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm11554B1AQB2 190 aa3.6□□□□□ -1.83
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa3.59□□□□□ -1.83
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa3.56□□□□□ -1.84
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa3.56□□□□□ -1.84
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa3.55□□□□□ -1.84
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Hmcn1D3YXG0 5634 aa3.5□□□□□ -1.85
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa3.5□□□□□ -1.85
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa3.47□□□□□ -1.85
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa3.42□□□□□ -1.86
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa3.37□□□□□ -1.87
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm2431E9Q8S1 172 aa3.37□□□□□ -1.87
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa3.31□□□□□ -1.88
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 A0A1Y7VJ07 166 aa3.28□□□□□ -1.88
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa3.25□□□□□ -1.89
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa3.21□□□□□ -1.9
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa3.18□□□□□ -1.9
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa3.18□□□□□ -1.9
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap5-5Q2TA51 241 aa3.18□□□□□ -1.9
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap5-4Q62220 223 aa3.18□□□□□ -1.9
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 NebE9Q1W3 7152 aa3.14□□□□□ -1.91
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa3.13□□□□□ -1.91
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 1110025L11RikO09048 78 aa3.1□□□□□ -1.91
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap6-5Q925H3 78 aa3.1□□□□□ -1.91
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa2.91□□□□□ -1.94
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 A0A286YCP9 139 aa2.83□□□□□ -1.96
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sprr2bO70554 98 aa2.77□□□□□ -1.97
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm10229O08631 77 aa2.77□□□□□ -1.97
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa2.67□□□□□ -1.98
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa2.65□□□□□ -1.99
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Phgr1Q8K0G7 91 aa2.56□□□□□ -2
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm11567Q9D141 195 aa2.55□□□□□ -2
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap21-1Q925H4 128 aa2.5□□□□□ -2.01
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa2.33□□□□□ -2.04
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap6-2O08884 159 aa2.32□□□□□ -2.04
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krtap5-1Q64507 230 aa1.83□□□□□ -2.12
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm4559A4IF42 199 aa1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 80 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.2 ms