RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637383.1

SMARCA2-262, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-262	ENST00000637383	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCA2-262	ENST00000637383	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCA2-262	ENST00000637383	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	FOXI1	Q12951	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	RIG	Q13278	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A087WYN8	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	OXT	P01178	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	XCL1	P47992	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	ADIRF	Q15847	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	NRAC	Q8N912	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	VCY	O14598	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	CCL25	O15444	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	PPP1R17	O96001	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	COX6A2	Q02221	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	PEA15	Q15121	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	FCER1G	P30273	86 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	SS18	Q15532	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	CAMP	P49913	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A1B0GW15	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A096LNI7	61 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383		A0A1B0GXF2	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PHOX2A	O14813	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	CKS2	P33552	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	HBB	P68871	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383		Q6ZRU5	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383		D6R8Y8	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383		F8W036	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	COX7A2L	O14548	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	TCAP	O15273	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	S100A8	P05109	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	MAL	P21145	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383		Q6ZUT4	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	STPG4	Q8N801	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	NPY	P01303	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PPBP	P02775	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-262	ENST00000637383	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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