RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0J9YY99 117 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GNG4P50150 75 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 CCL18P55774 89 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 CCL20P78556 96 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 BAGE2Q86Y30 109 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 C18orf15Q96N68 181 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 NAGKQ9UJ70 344 aa5.34□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GVY2 172 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 H3BNG1 76 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 SPINK4O60575 86 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 SLAQ13239 276 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 MUC21Q5SSG8 566 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 TVP23CQ96ET8 276 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 SGK494Q96LW2 274 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00479Q96M42 142 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 MED9Q9NWA0 146 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.33□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 XKRY2A2RUG3 117 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 B4DEV8 164 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 M0R2P5 195 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 CIDEAO60543 219 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ORM1P02763 201 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ASIPP42127 132 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 PTH2Q96A98 100 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 FAM210AQ96ND0 272 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf49Q96NF6 230 aa5.32□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 C9JCJ5 164 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 SH2D1AO60880 128 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-53P01767 116 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 CXCL1P09341 107 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 IFITM2Q01629 132 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 PEA15Q15121 130 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 CENPWQ5EE01 88 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 SYT8Q8NBV8 401 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 RASL10AQ92737 203 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 MLST8Q9BVC4 326 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 MDFICQ9P1T7 246 aa5.31□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 A0A096LPF7 62 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 TYMSP04818 313 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 MED14OSP0DP75 135 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ESRGQ1W209 222 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 TTC32Q5I0X7 151 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 TOR2AQ5JU69 321 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 DNLZQ5SXM8 178 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf223Q8N319 242 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 UPK3BQ9BT76 320 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 IL36BQ9NZH7 164 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 PRO0255Q9UI72 69 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.3□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 A8MWV9 139 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 PAX4O43316 350 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 P01737 135 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF876PQ49A33 203 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 PRR27Q6MZM9 219 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP82Q8N141 532 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 CDIP1Q9H305 208 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 Q9H8V8 135 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 HSPG2P98160 4391 aa5.29□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPQ1 181 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 M0R036 132 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 RHODO00212 210 aa5.28□□□□□ -1.56
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