RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 LHBP01229 141 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 HLA-DRB4P13762 266 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 POLEQ07864 2286 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 GP9P14770 177 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 ERCC8Q13216 396 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 KLRD1Q13241 179 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZPA2 131 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 C2orf82Q6UX34 121 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 TAX1BP3O14907 124 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 ATP6V0BQ99437 205 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 PATE2Q6UY27 113 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 DTX2Q86UW9 622 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 C20orf78Q9BR46 151 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 E7EQL1 145 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 PMVKQ15126 192 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01587Q99440 93 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 A0A087WX48 190 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF876PQ49A33 203 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 DKK2Q9UBU2 259 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 C9JAW5 83 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 CCL19Q99731 98 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 C12orf74Q32Q52 190 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 SPTBN2O15020 2390 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 H3BMG7 143 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 MORN5Q5VZ52 161 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 PCP2Q8IVA1 136 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 GTSF1Q8WW33 167 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GXF2 115 aa8.21□□□□□ -1.1
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PTPRM-205ENST00000577827 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 GTF3C1Q12789 2109 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-205ENST00000577827 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 RASL10AQ92737 203 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 UBE2E1P51965 193 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM131Q92545 1883 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-205ENST00000577827 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.2□□□□□ -1.1
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