RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484806.1

SFI1-223, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-223	ENST00000484806	UBE2G1	P62253	170 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF738	Q8NE65	137 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	FMC1	Q96HJ9	113 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	EPDR1	Q9UM22	224 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	STAB1	Q9NY15	2570 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TMEM218	A2RU14	115 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806		K7EQG2	157 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	IGLV1-51	P01701	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	EDN2	P20800	178 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	PSG3	Q16557	428 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	GUCA2B	Q16661	112 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	DCANP1	Q8TF63	244 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	LINC00052	Q96N35	136 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	RBAKDN	A6NC62	111 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	DIRC3	C9JPN6	131 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SOCS3	O14543	225 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TCRA	P04437	139 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF688	P0C7X2	276 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	S100A1	P23297	94 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TFPI2	P48307	235 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TAS2R60	P59551	318 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	PRR31	Q5SQ13	230 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SEC11C	Q9BY50	192 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	PARL	Q9H300	379 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	BIN3	Q9NQY0	253 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SORL1	Q92673	2214 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	VWF	P04275	2813 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF727	A8MUV8	499 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806		M0R3E3	92 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	GNG4	P50150	75 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	GNG5	P63218	68 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	PSMG4	Q5JS54	123 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	RNF182	Q8N6D2	247 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SMIM12	Q96EX1	92 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	OR11H12	B2RN74	326 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806		C9JCJ5	164 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	ATP6V1G1	O75348	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SVBP	Q8N300	66 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	LINC00477	Q96M19	166 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	NAT8	Q9UHE5	227 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806		C9JQL5	133 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SNAPIN	O95295	136 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	CT45A10	P0DMU9	189 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	HLA-DMB	P28068	263 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF138	P52744	262 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	DEFB131A	P59861	70 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	CENPW	Q5EE01	88 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806		Q86TA4	180 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	BAGE2	Q86Y30	109 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SFI1-223	ENST00000484806	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		6.03	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms