RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ENY2Q9NPA8 101 aa3.09□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 NRN1Q9NPD7 142 aa3.09□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.09□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A15Q9Y619 301 aa3.09□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CACNA1GO43497 2377 aa3.09□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.09□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GTF3C1Q12789 2109 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SZT2Q5T011 3432 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HELTA6NFD8 242 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 DEFB108AA8MXU0 73 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PEX7O00628 323 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FOXH1O75593 365 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FSTL3O95633 263 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C3orf79P0CE67 100 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SP9P0CG40 484 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HNF1AP20823 631 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CRYBB3P26998 211 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SRIP30626 198 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MYCNOSP40205 109 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CA7P43166 264 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF83P51522 516 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PRRX1P54821 245 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 BPIFB3P59826 476 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR5I1Q13606 314 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PSG5Q15238 335 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR4A5Q8NH83 315 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF596Q8TC21 504 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TSKUQ8WUA8 353 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 STARD4Q96DR4 205 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GAFA1Q96PS6 74 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR2V2Q96R30 315 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF492Q9P255 531 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MYO9BQ13459 2157 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SDK2Q58EX2 2172 aa3.08□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C2orf70A6NJV1 201 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 H0YJW9 148 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR7C2O60412 319 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DRB1P01911 266 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 APCSP02743 223 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CT45A6P0DMU7 189 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CT45A5P0DMU8 189 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CT45A7P0DMV0 189 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PMCHP20382 165 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TSPOP30536 169 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GLRXP35754 106 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 REG1BP48304 166 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF137PP52743 207 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 KRTDAPP60985 99 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 UBE2G1P62253 170 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SLAQ13239 276 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FXYD3Q14802 87 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LTC4SQ16873 150 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 DOLPP1Q86YN1 238 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LINC00311Q8N616 119 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GATD1Q8NB37 220 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GUCD1Q96NT3 240 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR8B2Q96RD0 313 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms