RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.22□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 Q6ZSN1 163 aa7.22□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.22□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 A0A0B4J2A0 478 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 A0A0J9YX75 114 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ISLRO14498 428 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ATG12O94817 140 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 TOMM40O96008 361 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 PMP2P02689 132 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 OR4E1P0C645 316 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 HTR2BP41595 481 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 RND2P52198 227 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 UCP3P55916 312 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ERVFC1-1P60608 527 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ICAM4Q14773 271 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ZFP69Q49AA0 526 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 RPRMQ9NS64 109 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 MDFICQ9P1T7 246 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 A8MTW9 85 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SOCS3O14543 225 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 INSP01308 110 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 C1QBP02746 253 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 RD3LP0DJH9 198 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 LINC00315P59091 139 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 C4orf46Q504U0 113 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SYT8Q8NBV8 401 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 DOK5Q9P104 306 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 GPR132Q9UNW8 380 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 IGKV1-5P01602 117 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 P0C879 139 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 AKR1C2P52895 323 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 RAP2BP61225 183 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 FCN2Q15485 313 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 AMTNQ6UX39 209 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 NOXA1Q86UR1 476 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 MITD1Q8WV92 249 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 HYLS1Q96M11 299 aa7.19□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 F6UB75 175 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 H3BNG1 76 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 B3GALNT1O75752 331 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 PSG1P11464 419 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 MEOX2P50222 304 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 KRTAP10-1P60331 282 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ESRGQ1W209 222 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 C2orf83Q53S99 150 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 RNF125Q96EQ8 232 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 UHRF2Q96PU4 802 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.18□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 C9orf170A2RU37 121 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ADAP1O75689 374 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SFT2D2O95562 160 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 PGAM2P15259 253 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 M6PRP20645 277 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SPCS3P61009 180 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 RND3P61587 244 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SRPXP78539 464 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 CD300CQ08708 224 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 FGL1Q08830 312 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 PPP1R1AQ13522 171 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 OR52E5Q8NH55 327 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 NPIPB3Q92617 1050 aa7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 GPR146Q96CH1 333 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms