RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PPQ1 181 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC01619G3V211 115 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 CORTO00230 105 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 SYNGR2O43760 224 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 ID3Q02535 119 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 FHL3Q13643 280 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf83Q53S99 150 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 KHDC3LQ587J8 217 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 DUX3Q96PT4 197 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 FBXL17Q9UF56 701 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087WWC5 75 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 K7EIM0 57 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 G3V4G9 280 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 EREGO14944 169 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC140Q96MF4 163 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-23P01764 117 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 IAPPP10997 89 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 FABP4P15090 132 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 S100A10P60903 97 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 S4R3C0 116 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2BKO60814 126 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV12-3P01733 135 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC3BP05452 202 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2BJP06899 126 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2BOP23527 126 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2BBP33778 126 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 MFAP4P55083 255 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2BDP58876 126 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2BCP62807 126 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB40CQ96S21 281 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-205ENST00000450873 ERVFC1-1P60608 527 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-205ENST00000450873 RPEL1Q2QD12 228 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 BMPR1BO00238 502 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 SSSCA1O60232 199 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 P2RY1P47900 373 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R30P59541 319 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 Q56UQ5 140 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-205ENST00000450873 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.13□□□□□ -1.11
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