RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 RAB11AP62491 216 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-224ENST00000551155 ID3Q02535 119 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-224ENST00000551155 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CS-224ENST00000551155 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CS-224ENST00000551155 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-224ENST00000551155 FBN3Q75N90 2809 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 WRBO00258 174 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 IFNA4P05014 189 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SLC25A4P12235 298 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 C5orf51A6NDU8 294 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 MPTX1A8MV57 137 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 A8MWP6 167 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 F8W735 103 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 NDUFA4O00483 81 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 PTTG1O95997 202 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 CSN3P07498 182 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 CTSGP08311 255 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 OR4X1Q8NH49 305 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 MARC2Q969Z3 335 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 C2orf70A6NJV1 201 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 C15orf62A8K5M9 175 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 FAM25EA8MYX2 175 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 K7EMT4 169 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 CLN5O75503 358 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 TMEM50AO95807 157 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 IGLV1-51P01701 117 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 IGHV3-48P01763 117 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 IAPPP10997 89 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 FOLR2P14207 255 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 CBLN1P23435 193 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 ADMP35318 185 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 CD69Q07108 199 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 OR10C1Q96KK4 312 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 C2orf50Q96LR7 162 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 RAB40CQ96S21 281 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 CCSO14618 274 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 YIF1AO95070 293 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SCGB1D2O95969 90 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 TAS2R30P59541 319 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 KRTAP10-11P60412 298 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 MLANAQ16655 118 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 LCN12Q6JVE5 192 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SMIM8Q96KF7 97 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 GINS3Q9BRX5 216 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 PSENENQ9NZ42 101 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 TMEM213A2RRL7 107 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SSSCA1O60232 199 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 C8orf88P0DMB2 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SPNP16150 400 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 RND2P52198 227 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 TM4SF20Q53R12 229 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-224ENST00000551155 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms