RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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RABGGTA-208ENST00000558954 OR5B12Q96R08 314 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 P2RX4Q99571 388 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM223BA6NKX1 122 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 P0C879 139 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ANXA3P12429 323 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMB6P28072 239 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 CCR6P51684 374 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 SRPXP78539 464 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.64□□□□□ -0.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 USMG5Q96IX5 58 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 DUX3Q96PT4 197 aa14.64□□□□□ -0.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF616Q08AN1 781 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 FHL3Q13643 280 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 NECAP1Q8NC96 275 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 OR11H1Q8NG94 326 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 IL22RA2Q969J5 263 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM56Q96MV1 263 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 HINT2Q9BX68 163 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 NOTCH1P46531 2555 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 LYRM1O43325 122 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 NDUFB6O95139 128 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 PRH1P02810 166 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 REG1AP05451 166 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 OR8U8P0C7N1 319 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 DEFA4P12838 97 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 BTCP35070 178 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 DEFA5Q01523 94 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM187Q14656 261 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF846Q147U1 533 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF429Q86V71 674 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 DBX1A6NMT0 343 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 VAMP1P23763 118 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB25P57735 213 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 DPF1Q92782 380 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 PLA2G10O15496 165 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 CYB5BO43169 146 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 OR13C7P0DN81 318 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 PRCDQ00LT1 54 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 WT1-ASQ06250 92 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 LGI3Q8N145 548 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC35G3Q8N808 338 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0B4J2A0 478 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0G2JRQ6 117 aa14.59□□□□□ -0.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 C15orf32Q32M92 178 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.59□□□□□ -0.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-208ENST00000558954 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A087WW49 117 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 LINC01619G3V211 115 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 ST8SIA3O43173 380 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R1AQ13522 171 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 KLK9Q2XQG4 91 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM209BQ5JX69 171 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-208ENST00000558954 THYN1Q9P016 225 aa14.58□□□□□ -0.08
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