RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf82Q7Z2V1 217 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 OR8H1Q8NGG4 311 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 MOB4Q9Y3A3 225 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 NPBQ8NG41 125 aa23.54■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 C1RLQ9NZP8 487 aa23.54■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 CACNG5Q9UF02 275 aa23.54■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 L7N2F9 121 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 HRASP01112 189 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 CXCL2P19875 107 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 OR2F1Q13607 317 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 PSG5Q15238 335 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 POU2AF1Q16633 256 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZRM9 215 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 OR1S1Q8NH92 325 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 RHOVQ96L33 236 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 MFFQ9GZY8 342 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 OR5AC2Q9NZP5 309 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1456Q9P272 454 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 BOLA1Q9Y3E2 137 aa23.53■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A17O43808 307 aa23.52■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFA3O95167 84 aa23.52■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 SCGB1D2O95969 90 aa23.52■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 ERVK-16P61578 105 aa23.52■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa23.52■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 SSX9Q7RTT3 188 aa23.52■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 Q8N9W7 124 aa23.52■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 DCUN1D4Q92564 292 aa23.52■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 AIFM2Q9BRQ8 373 aa23.52■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0D9SG52 128 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A26D6RGX4 464 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 RRHO14718 337 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 SPDEFO95238 335 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL15Q9H469 300 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 NF1P21359 2839 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 E5RGE8 158 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf56Q8N8D9 126 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 NSG2Q9Y328 171 aa23.51■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 FAM181BA6NEQ2 426 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 FGF16O43320 207 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 AMY1AP04745 511 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 UBE2KP61086 200 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 VMA21Q3ZAQ7 101 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 DMBX1Q8NFW5 382 aa23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 RNF222A6NCQ9 220 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 M0QZK8 103 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 PLGLAQ15195 96 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf64Q2M2E5 130 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 FOXRED2Q8IWF2 684 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 GON7Q9BXV9 100 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 TPSG1Q9NRR2 321 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 CACFD1Q9UGQ2 172 aa23.49■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 S100A11P31949 105 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 AARDQ4LEZ3 155 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 KCNRGQ8N5I3 272 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 AQP10Q96PS8 301 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 RASL11BQ9BPW5 248 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM77I1YAP6 450 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 CRYGBP07316 175 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 OR4A47Q6IF82 309 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf1Q9H5F2 150 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 SIGLEC9Q9Y336 463 aa23.48■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 BLCAPP62952 87 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 TMUB2Q71RG4 321 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 TEX45Q8NA69 505 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM140Q9NV12 185 aa23.47■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 P2RY1P47900 373 aa23.46■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R27Q86WC6 154 aa23.46■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 VSTM2AQ8TAG5 236 aa23.46■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 HSPB7Q9UBY9 170 aa23.46■■□□□ 1.35
ECHS1-201ENST00000368547 CLCC1Q96S66 551 aa23.45■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa23.45■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 SLA2Q9H6Q3 261 aa23.45■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 JMJD1CQ15652 2540 aa23.45■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 WRBO00258 174 aa23.44■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 KBTBD11O94819 623 aa23.44■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 OPCMLQ14982 345 aa23.44■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 RAB40CQ96S21 281 aa23.44■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 ARL6Q9H0F7 186 aa23.44■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 BET1LQ9NYM9 111 aa23.44■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 FCN1O00602 326 aa23.44■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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