RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 BTF3L4Q96K17 158 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00312Q9Y6C7 94 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 MIC13Q5XKP0 118 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 KCNIP4Q6PIL6 250 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 C16orf97H3BN30 126 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 PRRG2O14669 202 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 NPPCP23582 126 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 RPL29P47914 159 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 UTF1Q5T230 341 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM204Q9BSN7 226 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 FKBP11Q9NYL4 201 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 OR51B2Q9Y5P1 312 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 K7EM74 188 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 RHOBP62745 196 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 GNB1P62873 340 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 FAM216BQ8N7L0 139 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 SVILO95425 2214 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 GGCTO75223 188 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 MT-CO2P00403 227 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 SOD3P08294 240 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 ARL14EPLP0DKL9 152 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 C22orf34Q6ZV56 151 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 OR4X1Q8NH49 305 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 DSCAMO60469 2012 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 CA2P00918 260 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 CCKARP32238 428 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 GNG10P50151 68 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 UBE2G2P60604 165 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 DNLZQ5SXM8 178 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 LINC01551Q86U37 167 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 NECAP1Q8NC96 275 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 OR2T10Q8NGZ9 312 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 IMMP2LQ96T52 175 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 CHODLQ9H9P2 273 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHA3Q9HB20 300 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 SLC35D1Q9NTN3 355 aa16.04■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 DSCAML1Q8TD84 2053 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 UPK2O00526 184 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 TYMSP04818 313 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 ATP5G3P48201 142 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 LCN2P80188 198 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 PRCDQ00LT1 54 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 C4orf17Q53FE4 359 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 PYY3Q5JQD4 70 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 J3QR06 171 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFB4O95168 129 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 CT45A6P0DMU7 189 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 CT45A5P0DMU8 189 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 CT45A7P0DMV0 189 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 TCF15Q12870 199 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 NEUROG1Q92886 237 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf159Q96HA4 380 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 DMRT1Q9Y5R6 373 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 TANC2Q9HCD6 1990 aa16.03■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 CADP27708 2225 aa16.02■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 LOC400499M0QZD8 3231 aa16.02■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 C17orf100A8MU93 164 aa16.02■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00587B1AMM8 73 aa16.02■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFB7P17568 137 aa16.02■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 DOLPP1Q86YN1 238 aa16.02■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 STPG3Q8N7X2 389 aa16.02■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 BET1LQ9NYM9 111 aa16.02■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa16.02■□□□□ 0.16
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0G2JNJ9 132 aa16.02■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV2-70P01814 119 aa16.02■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 EFNB3Q15768 340 aa16.02■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 SSMEM1Q8WWF3 244 aa16.02■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 Q9UFV3 132 aa16.02■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PPQ1 181 aa16.01■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 VSTM5A8MXK1 200 aa16.01■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 MMP23AO75900 390 aa16.01■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 GFI1BQ5VTD9 330 aa16.01■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa16.01■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM183AQ8IXX5 376 aa16.01■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 OR5B3Q8NH48 314 aa16.01■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.01■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 TRAV20A0A0B4J274 112 aa16■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 OR4A8P0C604 315 aa16■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 GCHFRP30047 84 aa16■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 CCL8P80075 99 aa16■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 RELQ04864 619 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SPNS1-201ENST00000311008 ADIPOQQ15848 244 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms