RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC22CQ9BRL7 303 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANXA3P12429 323 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2E1P51965 193 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHODHQ02127 395 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF626Q68DY1 528 aa22.32■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF66Q6ZN08 573 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYG2Q86SG7 212 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ODF3L1Q8IXM7 274 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51H1Q8NH63 302 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG5Q9Y673 324 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PRD5 423 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PRF3 423 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PRM7 423 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 HTR1DP28221 377 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHRS2Q13268 280 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCTD9Q7L273 389 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPHA2Q96T91 129 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCA2Q9BZC7 2435 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf170A2RU37 121 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNA2P01563 188 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEACAM3P40198 252 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM71F2Q6NXP2 309 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52B4Q8NGK2 314 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4P4Q8NGL7 312 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASTOR1Q8WTX7 329 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf30Q96GV9 206 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0A6YYJ9 748 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNRPGP15A8MWD9 76 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFT2D2O95562 160 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF137PP52743 207 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC9A3R2Q15599 337 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADTRPQ96IZ2 230 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSMD1Q96PZ7 3565 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNK2Q9Y3S1 2297 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0B4J293 547 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ODF3BA8MYP8 253 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 LEUTXA8MZ59 168 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 B3GALNT1O75752 331 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 F2RP25116 425 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR157Q5UAW9 335 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPEQ96AT9 228 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPM3Q9P2X0 92 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CR1P17927 2039 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 THBS3P49746 956 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALNT14Q96FL9 552 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF251Q9BRH9 671 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51J1Q9H342 316 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 C7orf66A4D0T2 115 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 VGLL3A8MV65 326 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PROP1O75360 226 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5AC1P0C628 307 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHA1P21709 976 aa22.27■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SP6Q3SY56 376 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MINOS1Q5TGZ0 78 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHB2Q99623 299 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 BAHCC1Q9P281 2608 aa22.27■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV40A0A0B4J280 105 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GVG6 124 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 H0Y980 276 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSNA1O43805 119 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 REG1BP48304 166 aa22.26■■□□□ 1.15
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CTDNEP1-201ENST00000318988 UXS1Q8NBZ7 420 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 COQ8AQ8NI60 647 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TXNL1O43396 289 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL30P62888 115 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIDNQ504T8 468 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TP53RKQ96S44 253 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOTCH2Q04721 2471 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 CREBBPQ92793 2442 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPFFO15130 113 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV1-69P01742 117 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINE2P07093 398 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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