RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 HIST2H2BEQ16778 126 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 GPR157Q5UAW9 335 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 AADACL3Q5VUY0 350 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 HIST1H2BHQ93079 126 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 HIST1H2BNQ99877 126 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 HIST1H2BMQ99879 126 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 NSG2Q9Y328 171 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 A0A0A6YYD4 124 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 ZNF154Q13106 437 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 ELOBQ15370 118 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 RTN4RL2Q86UN3 420 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 OR2Z1Q8NG97 314 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 PRR13Q9NZ81 148 aa20.57■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 LRRK2Q5S007 2527 aa20.56■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 IFNA21P01568 189 aa20.56■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 KHDC3LQ587J8 217 aa20.56■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 SPRNQ5BIV9 151 aa20.56■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 PLK3Q9H4B4 646 aa20.56■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa20.56■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 DCHS2Q6V1P9 2916 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 GPR137BO60478 399 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 RHBDL1O75783 438 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 GRPP07492 148 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 SPNS3Q6ZMD2 512 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 BEND2Q8NDZ0 799 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 ZNF488Q96MN9 340 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 METTL9Q9H1A3 318 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 MTCH1Q9NZJ7 389 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 FBXO7Q9Y3I1 522 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 OR13C7P0DN81 318 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 IGFBP2P18065 325 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 ZNF573Q86YE8 665 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 SCCPDHQ8NBX0 429 aa20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 BCL3P20749 454 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 SELENOVP59797 346 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 CLEC9AQ6UXN8 241 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 TMEM204Q9BSN7 226 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 CXXC4Q9H2H0 198 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 TCAPO15273 167 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 SPRY3O43610 288 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 SOD3P08294 240 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 AMY2BP19961 511 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 GLRA1P23415 457 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 Q8WTZ3 238 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 GPR61Q9BZJ8 451 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 ZNF581Q9P0T4 197 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa20.54■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 LRP5LA4QPB2 252 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 CDIPTO14735 213 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 PRH1P02810 166 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 PI3P19957 117 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 FOXRED2Q8IWF2 684 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 C11orf53Q8IXP5 236 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 ERGIC1Q969X5 290 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 SMIM3Q9BZL3 60 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 MMP24Q9Y5R2 645 aa20.53■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 H3BQ15 152 aa20.52■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 PLAC9Q5JTB6 97 aa20.52■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 ZNF826PQ6ZT77 177 aa20.52■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 IL36GQ9NZH8 169 aa20.52■□□□□ 0.88
CTU1-201ENST00000421832 J3QT63 122 aa20.52■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 K7N7A8 449 aa20.52■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 SOCS1O15524 211 aa20.52■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 RAB39BQ96DA2 213 aa20.52■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 MISP3Q96FF7 219 aa20.52■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 IL36RNQ9UBH0 155 aa20.52■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 CXCL1P09341 107 aa20.51■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 PIGYQ3MUY2 71 aa20.51■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 FBXL14Q8N1E6 418 aa20.51■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 OR51T1Q8NGJ9 327 aa20.51■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 PKIBQ9C010 78 aa20.51■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 TMEM210A6NLX4 147 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 DVL1O14640 695 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 GLIPR1P48060 266 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 UBE2KP61086 200 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 IL24Q13007 206 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 SAXO1Q8IYX7 474 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 Q96M66 194 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 A0A1W2PPR1 153 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 RBFOX3A6NFN3 312 aa20.5■□□□□ 0.87
CTU1-201ENST00000421832 B4DEV8 164 aa20.5■□□□□ 0.87
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