RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GPR146	Q96CH1	333 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MISP3	Q96FF7	219 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GNB4	Q9HAV0	340 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CAMP	P49913	170 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	BLNK	Q8WV28	456 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM230	Q96A57	120 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	VAMP8	Q9BV40	100 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087X0M5	115 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GX30	115 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	hADV38S2	A0JD32	116 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		B4DEV8	164 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		B4E171	279 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TRGC2	P03986	189 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC3B	P05452	202 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN7	P41732	249 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM187	Q14656	261 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF383	Q8NA42	475 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR4C12	Q96R67	309 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ABCA4	P78363	2273 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		H0Y980	276 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NPIPB7	O75200	414 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR2H2	O95918	312 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ORM2	P19652	201 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	AMT	P48728	403 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RND3	P61587	244 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PSG5	Q15238	335 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SSX7	Q7RTT5	188 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TP53RK	Q96S44	253 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PTPRD	P23468	1912 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FBP1	P09467	338 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	B2M	P61769	119 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A28	Q96A46	364 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	HBZ	P02008	142 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RBP4	P02753	201 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CRISP2	P16562	243 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	COX7A1	P24310	79 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SERF2	P84101	59 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf128	Q5T292	105 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FGFRL1	Q8N441	504 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR1L1	Q8NH94	360 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CACNA1B	Q00975	2339 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	WDR90	Q96KV7	1748 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	DANCR	P0C864	163 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	S100A7	P31151	101 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	IER2	Q9BTL4	223 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM157C	P0CG43	387 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NPY1R	P25929	384 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	UCP2	P55851	309 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	STARD6	P59095	220 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3

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