RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 MADCAM1Q13477 382 aa9.26□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 SSX2Q16385 188 aa9.26□□□□□ -0.93
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GARNL3-217ENST00000481875 CNIH2Q6PI25 160 aa9.26□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.26□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 TCF23Q7RTU1 214 aa9.26□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.26□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 LAX1Q8IWV1 398 aa9.26□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.26□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 SETD6Q8TBK2 473 aa9.26□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 CCDC107Q8WV48 283 aa9.26□□□□□ -0.93
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GARNL3-217ENST00000481875 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.26□□□□□ -0.93
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GARNL3-217ENST00000481875 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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GARNL3-217ENST00000481875 CORO2AQ92828 525 aa9.23□□□□□ -0.93
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GARNL3-217ENST00000481875 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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GARNL3-217ENST00000481875 PEX14O75381 377 aa9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 TPPPO94811 219 aa9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 NAPSAO96009 420 aa9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV1-47P01700 117 aa9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 HTR1DP28221 377 aa9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 CD34P28906 385 aa9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.22□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.22□□□□□ -0.93
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