RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ZG16BQ96DA0 208 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DISP1Q96F81 1524 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPM0 123 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 B4GALT1P15291 398 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CRYBB3P26998 211 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SPANXN5Q5MJ07 72 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SMPXQ9UHP9 88 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 F8WDY8 70 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IGHA2P01877 340 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 EDDM3AQ14507 147 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ACTL10Q5JWF8 245 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35E4Q6ICL7 350 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 VN1R2Q8NFZ6 395 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 GLMPQ8WWB7 406 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IL1F10Q8WWZ1 152 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FIZ1Q96SL8 496 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PAGE4O60829 102 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 KLKB1P03952 638 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C3orf79P0CE67 100 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IL3RAP26951 378 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OR1C1Q15619 314 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP5Q16690 384 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LHX8Q68G74 356 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C19orf48Q6RUI8 117 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OOSP2Q86WS3 158 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SAXO1Q8IYX7 474 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 BRK1Q8WUW1 75 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT8Q8WV74 236 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SIRPDQ9H106 197 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 KCNK15Q9H427 330 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 H3BP45 60 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SLC17A2O00624 439 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DPM2O94777 84 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM50AO95807 157 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 EML2O95834 649 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 WNT2P09544 360 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 PSG4Q00888 419 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM215Q68D42 235 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SOSTQ9BQB4 213 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CHST8Q9H2A9 424 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 AMY1AP04745 511 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ICAM1P05362 532 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PRDX2P32119 198 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CDKN1AP38936 164 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DYNLT3P51808 116 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RHOGP84095 191 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 KLRD1Q13241 179 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CD226Q15762 336 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DCBLD2Q96PD2 775 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 VPREB3Q9UKI3 123 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 MMP17Q9ULZ9 603 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OARD1Q9Y530 152 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TRIP11Q15643 1979 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ABCA7Q8IZY2 2146 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DLC1Q96QB1 1528 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PRE2 83 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 BCL3P20749 454 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 MFAP2P55001 183 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PRR31Q5SQ13 230 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NAT6Q93015 286 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SARAFQ96BY9 339 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 BORCS8Q96FH0 119 aa4.86□□□□□ -1.63
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