RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 SYNGR1O43759 233 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 CCL1P22362 96 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 C3AR1Q16581 482 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 OR4D5Q8NGN0 318 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 TM2D1Q9BX74 207 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 POMT1Q9Y6A1 747 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX1-201ENST00000261889 KALRNO60229 2985 aa11.15□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CCL4P13236 92 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TCN2P20062 427 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ALDH3B1P43353 468 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CLN3Q13286 438 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 IL22RA1Q8N6P7 574 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 PP6455Q8WZ26 134 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 MVB12AQ96EY5 273 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 V9GYS6 101 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 A0A1W2PPQ1 181 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 NGFP01138 241 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 IGHV3-13P01766 116 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 IGHV3-7P01780 117 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 DPPA2Q7Z7J5 298 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 SLC25A22Q9H936 323 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 BTBD17A6NE02 478 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 WDR1O75083 606 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 NXPH1P58417 271 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 HMGN3Q15651 99 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TVP23CQ96ET8 276 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TREM2Q9NZC2 230 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 WASF3Q9UPY6 502 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 OR5H1A6NKK0 313 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CYTIPO60759 359 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CADM4Q8NFZ8 388 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 YPEL4Q96NS1 127 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 RBKSQ9H477 322 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 MED13Q9UHV7 2174 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TRDCB7Z8K6 153 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 M0R296 226 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TGFBR3Q03167 851 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ZNF726P1Q15940 193 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ZNF787Q6DD87 383 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ZNF100Q8IYN0 542 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TMEM105Q8N8V8 129 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 OR1F12Q8NHA8 337 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 MOB3AQ96BX8 217 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 GALNT14Q96FL9 552 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ARV1Q9H2C2 271 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 SLC22A20A6NK97 555 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 BCO1Q9HAY6 547 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CACNG5Q9UF02 275 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ZIC3O60481 467 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 PDCD6O75340 191 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 GLB1P16278 677 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 IL2RGP31785 369 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 HLA-DRB3P79483 266 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 HIST3H3Q16695 136 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 PRR31Q5SQ13 230 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 HIST1H2BLQ99880 126 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 RARRES3Q9UL19 164 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 C5orf49A4QMS7 147 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CRYAAP02489 173 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 DDTP30046 118 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 ZNF266Q14584 549 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 IL13RA2Q14627 380 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 RTL6Q6ICC9 239 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 PISDQ9UG56 409 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX1-201ENST00000261889 TK1P04183 234 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms