RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WWC5 75 aa14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GUS0 222 aa14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PQD3 144 aa14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 BOD1Q96IK1 185 aa14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 YPEL4Q96NS1 127 aa14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TBX15Q96SF7 602 aa14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MYOTQ9UBF9 498 aa14.06□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINE3A8MV23 424 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OPN1MWP04001 364 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FGF5P12034 268 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GALR1P47211 349 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM187Q14656 261 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ASB10Q8WXI3 467 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DDIT4LQ96D03 193 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LIME1Q9H400 295 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CALHM2Q9HA72 323 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PNV4 684 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNA7P36544 502 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MS4A10Q96PG2 267 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CHST1O43916 411 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS8Q16651 343 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PATE3B3GLJ2 98 aa14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RAB4AP20338 218 aa14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DLEU1O43261 78 aa14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TP53RKQ96S44 253 aa14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IAPPP10997 89 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SHBQ15464 509 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OR6X1Q8NH79 312 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 COL4A2P08572 1712 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SIAH2O43255 324 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LYPD6Q86Y78 171 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GLRX2Q9NS18 164 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 V9GYS6 101 aa14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AQP7O14520 342 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GCGP01275 180 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF43P17038 809 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF92Q03936 586 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CALHM1Q8IU99 346 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RPRMQ9NS64 109 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.02□□□□□ -0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MAS1LP35410 378 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ERVFC1-1P60608 527 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DOK3Q7L591 496 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-CQ95604 372 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LHX4Q969G2 390 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ARV1Q9H2C2 271 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS50Q9UI38 385 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GU03 582 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LIPT2A6NK58 231 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CEACAM1P13688 526 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 AADACP22760 399 aa14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.6 ms